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目的：探讨湖南地区人群早发冠心病血瘀证与AGT基因和Apoe基因多态性的关系。方法：通过基于飞行时间质谱分析技术(TOF-MS)和等位基因特异性PCR技术方法,从湖南地区人群中选取早发冠心病血瘀证患者50例、早发冠心病非血瘀证患者26例、非早发冠心病患者36例和健康对照组19例,对AGT基因多态性位点Rs4762(T174M/C3889T)和Rs699(M235T/T4072C)、Apoe基因多态性位点Rs7412(ε4)和Rs3760627进行检测,分析四组等位基因频率以及基因型频率的差异性。结果：AGT基因多态性位点Rs4762和Rs699等位基因和基因型在四组间的频率分布的差异有统计学意义(P<0.05),Rs4762的C型等位基因在早发冠心病血瘀证组与健康对照组之间的比较具有显著差异性(χ2=14.872,P<0.01),CC型基因的频率分布在早发冠心病血瘀证组与健康对照组之间的比较有显著差异,(χ2=13.371,P<0.01)；Rs699的C型等位基因的频率分布在早发冠心病血瘀证组与健康对照组之间的比较具有显著差异性(χ2=9.512,P<0.01),CC型基因的频率分布在早发冠心病血瘀证组与健康对照组之间的比较有差异性。(χ2=7.889,P<0.05)。Apoe基因多态性位点Rs7412等位基因和基因型在四组间的频率分布的差异有统计学意义(P<0.05),R s4712的C型等位基因在早发冠心病血瘀证组与健康对照组之间的比较具有差异性(χ2=6.283,P<0.05),CC型基因的频率分布在早发冠心病血瘀证组与健康对照组之间的比较有差异性,(χ2=8.166,P<0.05)Apoe基因多态性位点Rs3760627等位基因和基因型在四组间的频率分布的差异无统计学意义(P>0.05)。结论：AGT基因多态性位点Rs4762、Rs699与湖南地区人群早发冠心病血瘀证均有相关性,Rs4762和Rs699的C型等位基因是湖南地区人群早发冠心病血瘀证的易感基因。Apoe基因多态性位点Rs7412与湖南地区人群早发冠心病血瘀证有相关性,Rs7412的C型等位基因是湖南地区人群早发冠心病血瘀证的易感基因；Apoe基因多态性位点Rs3760627与湖南地区人群早发冠心病血瘀证无相关性。