本实验以P98-1B62、Z137、79-1E等16个玉米自交系为亲本,按不完全双列杂交(10×6)配成60个杂交组合,对株高、穗位、单株粒重等13个主要性状进行了配合力及遗传相关和通径分析.此外又结合醇溶蛋白、盐溶蛋白和RAPD标记对参试的16个自交系进行了遗传多样性分析,在此基础上进行了类群的划分和分析.结果如下:(1)配合力分析结果表明对于单株粒重性状,一般配合力表现较好的自交系有9、16、1、14、7、4、15等;特殊配合力表现较好的组合有814、116、712、1015、516等;总配合力表现较好的组合有116、814、916、915、914等.对配合力基因型方差及遗传力的估算结果表明,株高、穗位、穗粗、穗行数在早期世代进行直接选择效果较好;穗三叶面积、穗长、秃尖长、行粒数、百粒重、出籽率、丝黑穗病的病株率在早期世代进行选择,效果不理想;单株穗重和单株粒重不宜进行直接选择.通径分析结果表明各农艺性状与产量的相对重要性依次为单株穗重、出籽率、穗长、穗粗、穗三叶面积、株高、穗行数、秃尖长、百粒重、穗位、行粒数.(2)通过醇溶蛋白、盐溶蛋白和RAPD标记技术对16个亲本自交系进行遗传多样行分析,结果表明,对于醇溶蛋白平均每个自交系分离出1.9条多态性谱带,对于盐溶蛋白平均每个自交系分离出2.1条多态性谱带,对于RAPD标记,从85个引物中共筛选出13个能够稳定扩增的多态性引物,平均每个自交系扩增出7条多态性谱带,表现出了比较丰富的遗传多样性.在此基础上又进行了类群划分,三种方法聚类结果基本一致.表明这三种"指纹图谱"均可以作为进行遗传多样性研究的有效手段,为玉米杂种优势利用中的亲本选配提供重要参考依据.(3)为了探讨三种标记与产量杂种优势之间的关系,本研究又对三种标记所得自交系间的遗传距离与F1单株粒重及单株粒重特殊配合力进行了简单相关分析,结果只有盐溶蛋白所得的相对应遗传距离与单株粒重间的相关显著(r=0.307<*>).表明醇溶蛋白、盐溶蛋白以及本实验所得出的RAPD标记,均不能有效地进行杂种优势的预测,只能作为辅助手段.要利用分子标记进行杂种优势的预测,并选育出产量高的组合应用于生产,必须有目的地建立作图群体,找出与产量性状基因紧密连锁的标记.