双胞胎外周血BCR-H CDR3受体库同质性与异质性分析

来源 :遵义医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hfs191
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:以年龄在20-50岁之间的健康同卵(Monozygotic,MZ)双胞胎、异卵(Dizygotic,DZ)双胞胎、非双胞胎(Non-twins,NT)为研究对象,分析MZ双胞胎、DZ双胞胎、NT三组之间外周血BCR-H假基因CDR3受体库(Pseudogene CDR3 repertoires)、框架外CDR3受体库(Out of frame rearrangement CDR3 repertoires)和功能性CDR3受体(Produtive CDR3 repertoires)库的同质性与异质性,以及BCR-H CDR3受体库前后5年之间的差异,初步探讨BCR-H CDR3受体库的形成机制,为进一步研究BCR的重排机制和应用提供基础。方法:1、采集健康双胞胎志愿者(D、e、F、G、h、i)外周血10ml,分离PBMCs(外周血单个核细胞)并提取DNA;设计并合成BCR-H CDR3受体库引物(7条含总IGHV家族上游引物,9条含功能基因和假基因IGHJ家族下游引物);然后以DNA为模板进行PCR扩增,胶回收PCR扩增产物送至华大基因,完成质检之后采用Illumina Solexa高通量技术进行测序。2、分别在2012年和2017年,采集健康双胞胎志愿者(A、B、c)外周血10ml,分离PBMCs并提取DNA;2012年样本DNA送至Adaptive Biotechnologies immune SEQ公司(美国华盛顿医院),2017年样本DNA送至华大基因,均采用PCR技术建立BCR-H CDR3受体库,并使用Illumina Solexa高通量技术进行测序(2012年的实验由课题组完成)。3、将9对健康双胞胎志愿者的DNA样本送至北京博奥晶典生物技术有限公司,采用PCR-SBT方法对HLA-A/B/C/DRB1位点进行分型检测。4、分析BCR-H CDR3受体库测序结果:(1)对比分析MZ双胞胎(D1/D2,F1/F2,G1/G2)、DZ双胞胎(e1/e2,h1/h2,i1/i2)和NT(D1/e1,D1/F1,D1/G1,D1/h1,D1/i1)假基因CDR3、框架外CDR3以及功能性CDR3受体库的同质性与异质性;(2)对比分析前后5年MZ双胞胎(A1/A2,B1/B2)、DZ双胞胎(c1/c2)和NT(A1/B1,A1/c1,A1/c2,B1/c1,B1/c2)BCR-H CDR3受体库的变化。结果:1、HLA分型检测显示:双胞胎A、B、D、F、G为同卵双胞胎,双胞胎c、e、h、i为异卵双胞胎。2、BCR-H CDR3受体库多样性分析:MZ双胞胎、DZ双胞胎、NT之间多样性无统计学差异(P>0.05);三组之间的高频率克隆(Highly expand clones,HEC)分析显示MZ双胞胎、DZ双胞胎均与NT存在统计学差异(MZ&NT:P=0.017;DZ&NT:P=0.01)。前后五年的BCR-H CDR3受体库多样性分析无统计学差异(P=0.116)。3、BCR-H CDR3受体库IGHV、IGHJ基因取用:在假基因、框架外和功能性CDR3受体库中IGHV取用有差异的基因家族均是双胞胎之间的差异最小;前后5年的变化也显示出MZ双胞胎之间最相似,尤其是在假基因CDR3受体库中。IGHJ取用在假基因CDR3受体库和框架外CDR3受体库中MZ双胞胎、DZ双胞胎、NT三组没有统计学差异(P>0.05),但在功能性CDR3受体库中IGHJ1家族取用频率表现出统计学差异(MZ&NT:P=0.007;DZ&NT:P=0.004)),并且双胞胎之间最相似;前后5年的变化在假基因CDR3受体库和框架外CDR3受体库中MZ双胞胎最相似,但是在功能性CDR3受体库中MZ双胞胎、DZ双胞胎、NT三组之间没有统计学差异(P>0.05)。4、BCR-H CDR3受体库氨基酸(Amino acid,AA)取用、AA长度分布和AA重叠分析:MZ双胞胎、DZ双胞胎和NT之间的AA取用、AA长度分布以及AA重叠均无统计学差异(P>0.05);前后5年的变化也无统计学差异(P>0.05)。5、BCR-H CDR3受体库核苷酸的插入与缺失:在功能性CDR3受体库中,相比于NT,MZ双胞胎之间和DZ双胞胎之间V(D)J连接处插入与缺失不同核苷酸数目的比例更为相似,前后5年的变化在MZ双胞胎、DZ双胞胎、NT三组之间无统计学差异(P>0.05);在假基因CDR3受体库和框架外CDR3受体库中这种相似性几乎没有,MZ双胞胎之间、DZ双胞胎之间、NT之间前后5年的变化存在不一致。结论:1、BCR-H假基因CDR3受体库IGHV取用,与NT(D1/e1,D1/F1,D1/G1,D1/h1,D1/i1)比较,MZ双胞胎(D1/D2,F1/F2,G1/G2)和DZ双胞胎(e1/e2,h1/h2,i1/i2)存在更多的同质性;前后5年IGHV取用相比于DZ双胞胎(c1/c2)之间和NT(A1/B1,A1/c1,A1/c2,B1/c1,B1/c2)之间,MZ双胞胎(A1/A2,B1/B2)之间的变化表现更一致。这提示V(D)J初始重排过程中IGHV取用有一定的遗传偏向性,这种偏向性可能影响个体外周的初始B细胞受体库的组成和特征,从而影响个体对外周抗原的免疫应答。2、在功能性CDR3受体库中AA取用、AA长度分布、AA重叠以及核苷酸的插入与缺失在MZ双胞胎(D1/D2,F1/F2,G1/G2)、DZ双胞胎(e1/e2,h1/h2,i1/i2)和NT(A1/B1,A1/c1,A1/c2,B1/c1,B1/c2)之间没有存在统计学差异;前后5年的AA取用、AA长度分布、AA重叠以及核苷酸的插入与缺失的变化在MZ双胞胎(A1/A2,B1/B2)、DZ双胞胎(c1/c2)和NT(A1/B1,A1/c1,A1/c2,B1/c1,B1/c2)之间无统计学差异。这提示遗传因素对BCR-H功能性CDR3受体库的AA取用、AA长度分布、AA重叠以及核苷酸的插入与缺失影响较小,长期的外界环境抗原刺激后,可能“稀释”了个体外周血总B细胞受体库的遗传偏向。
其他文献
统编版小学语文教材的课后练习作为练习系统的重要组成部分,严格按照范文系统、学科知识系统配套编写,与每课教学重点相对应,具有极高的使用价值。但由于统编教材投入使用时
建筑存量是城市建设活动中的物质积累,伴随大量资源能源的消耗、积累及排放,也为社会经济发展提供服务。经济、人口等因素引致的对建筑存量需求的增加会引发资源、环境双重压力,进而制约城市可持续发展。近二十年,北京城市面积急速扩张,人口稳步增长,城市化进程显著,相应的房屋和基础设施存量发生较大演变,对资源和环境产生巨大压力。因而量化建筑存量,分析并理解其积累过程和机制是是十分必要的,这将有助于评估北京建筑存
<正>4月7日是第68个"世界卫生日",世界卫生组织将今年的主题定为"一起聊聊抑郁症",号召全球人民一起关注抑郁症问题。为大力普及抑郁症等疾病健康防治知识,营造健康生活环境,
银杏是药食同源性植物,具有抗氧化、抑菌等作用,含有很多活性成分如蛋白、黄酮等,在医药和食品领域有着广泛的应用。但银杏资源的生长受气候、地域等影响,从而影响其开发与利
作为中国传统文化的重要组成部分,佛教文化中蕴含着丰富的动画造型设计理念,因此对中国动画中佛教艺术形象的应用研究有益于动画产业的发展和传统文化的复兴。然而,由于研究
研究潜孔锤内部动力过程,优化潜孔锤性能,研制系列适应于不同工况条件及领域的特殊性能潜孔锤,以满足各种钻孔工程需求。将多种先进钻孔工艺方法融于潜孔锤钻进中,形成多工艺潜孔
目的观察腰-硬联合麻醉对老年股骨上段手术病人肾素-血管紧张素(RAS)的影响.方法40例ASAⅠ~Ⅲ级老年择期手术病人,随机分为硬膜外麻醉组(EA组,n=20)和腰-硬联合麻醉组(CSEA组,n=20).
针对某厂W火焰无烟煤锅炉燃用烟煤、褐煤时出现的问题进行分析,提出加强煤场管理、改变上仓掺烧方式、调整制粉系统运行参数和加强爆炸、火灾安全风险管控等一系列措施,使锅
随着互联网金融的快速发展,P2P网络借贷也逐步开始涉足&#39;三农&#39;服务领域,并形成了一定的发展规模,对促进&#39;三农&#39;事业发展产生了一定的作用。但由于相关法律法规
建筑业所占温室气体排放量和能源消耗量巨大,如何改变这一现状是很多研究者所关注的。人们越来越重视能够在低成本建筑和提高建筑物可持续性之间创造适当的平衡。近年来,建筑