目前，我国证券市场对中小股东的利益保护十分薄弱，上市公司“内部人”虚假陈述甚至是操纵股价的行为时有发生，受损失最为惨重的就是中小股东。这些事件的发生挫伤了广大投资者对证券市场的投资热情，严重的话还可能造成整个资本市场投资者信心的崩溃。在这种情况下，中国证监会提出在上市公司推行独立董事制度，以监管上市公司“内部人”，保护广大中小股东的利益。但独立董事制度实施以来，所发挥的作用并不明显，“花瓶”董事现象普遍存在。主要原因在于，我国的独立董事制度，尤其是独立董事薪酬制度，还存在很多重大缺陷。独立董事在我国公司治理中作用的发挥，有赖于建立有效的独立董事的约束和激励机制。在我国，由于欠缺声誉机制的激励作用和法律保证的约束作用，独立董事的薪酬机制对独立董事能否在公司治理中有效发挥作用具有重要影响，因此完善独立董事薪酬制度具有十分重要的意义。对独立董事薪酬制度的分析表明，薪酬制度的缺陷主要体现在存在薪酬激励与独立董事独立性之间的“悖论”；对独立董事激励性不强；不能真实的反映独立董事的工作绩效等三个方面。笔者针对这些缺陷，提出完善我国独立董事薪酬制度的若干建议：建立独立董事间接薪酬制度；优化独立董事薪酬结构；建立和完善独立董事工作绩效评价体系。