NRP1及相关基因的单核苷酸多态性与晚期胃癌一线化疗相关性

来源 :大连医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nj_lcj
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背景和目的胃癌是我国最常见的消化道恶性肿瘤,其发病率和死亡率高居我国恶性肿瘤中第二位。NRP-1是一种重要的Ⅰ型跨膜蛋白,参与肿瘤的发生、发展,它主要通过3条途径参与调节肿瘤的生物学活动:VEGF-VEGFR2通路、PDGF-PDGFR通路、NRP-1-ABL通路。目前发现其涉及的生物学作用包括促进肿瘤的发生、发展,促进肿瘤血管新生,促进肿瘤的迁移、侵袭,参与调节肿瘤对于化疗药物等的敏感性。单核苷酸多态性是第三代遗传标记物,指同一位点的不同等位基因之间仅有个别核苷酸的差异或只有小的插入、缺失等,可以直接影响蛋白质表达和功能,其具有遗传稳定、分布广泛、频率易统计、易分析、适于大规模筛查的优点。目前已有的研究显示,在胃癌的个体差异中,遗传因素起到极大作用。但是目前与胃癌相关的SNP研究仍主要集中在疾病的易感性方面,在晚期胃癌的化疗敏感性方面仍然缺乏相关研究。本研究拟结合目前在晚期胃癌中遇到的问题,结合最新的技术手段,从DNA水平上分析NRP-1及其所参与的通路中部分基因的SNP与晚期胃癌治疗之间的关系,希望能为预测化疗敏感性等提供可能的标志,以达到个体化治疗的目的。材料与方法选取2010年1月至2016年5月于大连医科大学附属第二医院的晚期胃癌化疗患者共82例,取出其病理石蜡标本,使用QIAamp DNA FFPE Tissue Kit试剂盒提取DNA。在NCBI的1000 genome projects的公共SNP数据库中选择目标基因的标签SNP位点,根据所在位置和以往文献进行筛选,采用SNaPshot方法进行测序,检测患者的基因多态性。根据患者的临床病历资料收集患者的临床信息,并通过临床随访和电话随访进一步完善相关信息。使用RECIST标准评价患者化疗疗效。针对各组患者临床资料的差异,使用SPSS 22.0统计软件分析各位点的多态性频率,计算其在胃癌患者中的分布。分别在共显性、显性、隐性模型下基因型与疾病进展的关系采用非条件Logistic回归分析,并计算OR值及其95%CI。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,经Log Rank检验。结果82例患者中57例(69.5%)为男性,25例(30.5%)为女性,较为符合胃癌发病率男性多于女性的特征。患者中位年龄60.5岁。病理分化为低分化患者有54例(65.9%),中-高分化患者有28例(34.1%)。可确定T分期患者79例,其中T1-2患者6例(8%),T3-4患者73例(92%)。经Logistic回归分析,KDR基因的RS7692791位点的CT基因型为化疗不敏感的危险因素,携带CT基因型的患者化疗不敏感的风险较携带TT基因型患者高(OR=3.798,95%CI=1.061-13.587,P=0.040),显性模型下(TT/CT+CC),基因型和化疗敏感性存在关联(OR=3.491,95%CI=1.013-12.029,P=0.048),野生型患者对化疗较敏感。其余各位点基因多态性与化疗敏感性无关联(P>0.05)。生存分析显示,KDR基因的RS2305948位点的显性模型中(CC/CT+TT),野生纯合CC基因型的PFS较长,为5个月,而突变型CT+TT基因型的PFS为2.5个月,差异有统计学意义(x2=4.268,P=0.039),NRP-1基因的RS2273466位点的隐性模型中(AA+GA/GG),突变纯合型GG的PFS较短,仅为1.5个月,而AA+GA的PFS为4.5个月,差异有统计学意义(x2=5.643,P=0.018)。各位点与OS均无关联。结论1.KDR基因的RS7692791位点的CT基因型为化疗不敏感的危险因素,显性模型下野生CC基因型一线化疗疗效较突变型CT+TT好,提示此位点可能与化疗敏感性相关。2.KDR基因的RS2305948位点的野生型拥有较长的PFS,提示其多态性可能影响晚期胃癌患者的PFS。3.NRP-1基因的RS2273466位点的突变纯合子基因型的PFS较短,提示其多态性与晚期胃癌患者的PFS可能有密切关系。
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