人类社会进入21世纪以来,科学技术的发展日新月异,全球一体化的浪潮更加汹涌澎湃。生产要素在全球范围内的快速流动,使得区域内的产业集群已经成为带动区域经济繁荣,促进产业结构升级的主要动力。如何有效地利用创新资源为区域产业集群发展服务,使其能够产生更大的经济效益和社会效益,已成为人们关注的焦点。近年来,在区域经济与管理的学术领域内,从区域创新和集群创新视角进行研究的理论成果颇为丰富,但将二者统一起来,系统地对区域集群式自主创新进行探讨的研究还不多见,在这一范畴还缺乏相应统一的理论指导。要加快创新进程,优化创新资源,提升区域产业集群创新能力,就必须对这类问题做出回答。基于以上目的,本文利用理论研究与实证研究相结合,定性研究与定量研究相结合的手段,采取了统计分析法、数学模型法、实证分析法等研究方法,探讨了区域集群式自主创新体系的结构、自主创新能力、合作机制以及区域集群式自主创新的政策体系,并以安徽区域集群式创新现状为实证研究,力图为区域集群自主创新体系的构建和完善提供借鉴和参考。本文所做的主要工作及创新性研究成果如下:(1)通过有关文献综述,阐述了区域创新和集群创新的相关概念、基本特征及构成要素等内容,并在此基础上建立起区域集群式自主创新体系的框架思路,对体系的各个构成要素——技术创新体系、知识创新体系、科技成果转化体系、科技人才支撑体系、创新投融资体系及科技服务体系、环境支撑体系进行了细致的探讨,并提出它们之间的互动机制:动力机制、约束机制与共享机制。(2)对区域集群式自主创新能力的内涵进行了界定,将其划分为集群的自我发展能力、创新投入能力、成果转化能力、环境支撑能力和创新产出能力五个部分,并对区域集群式自主创新能力与区域发展的关系进行了研究。(3)对区域集群式自主创新企业技术创新投资与合作的动力机制进行了研究,对区域集群式自主创新企业之间的合作进行了博弈分析。并在此基础上将企业技术创新分工程度和市场竞争程度这两个主要因素进行组合,对集群企业之间技术创新合作的特点以及促进技术创新合作的思路进行了矩阵分析。(4)对区域集群式自主创新体系的政策要素进行了分析,包括创新投入政策,税收与金融政策,创新人才政策要素,创新成果转化政策,政府采购政策,以及科技服务政策。并以区域集群自主创新的各个环节为载体,说明了各类政策的作用机制。(5)对安徽区域集群式自主创新体系进行了分析,从主导产业创新能力、集群式创新成果、创新成果转化、创新知识产出和区域R&D投入等方面对创新能力进行了评价,并依据评价结果提出了提高自主创新能力的相关措施建议。上述研究结论丰富了区域集群创新领域的研究成果,在实践中可以指导区域产业集群的创新活动,并为地方政府制定相关创新政策提供借鉴。