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松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)是一种重要的检疫性线虫。松材线虫病是国际上公认的松树毁灭性病害,该病害的防治和控制工作进展缓慢。随着分子生物学研究的深入,运用分子生物学技术研究其致病机理以及寻找控制该病害的方法成为可能。本文以松材线虫类甲状腺转运蛋白(Transthyretin-like,TTL)为研究对象,首次克隆了松材线虫Bx-ttl基因的编码区序列,并用RNAi的方法研究了Bx-ttl基因基因的功能,同时,用原位杂交的方法对Bx-ttl基因在松材线虫上进行组织定位。本研究主要结果如下:
1用RACE和TAIL技术,首次获得松材线虫423bp的cDNA全长序列,命名为Bx-ttl,DNA编码区为579bp,编码区包含有1个内含子,2个外显子。内含子的大小分别为156bp,2个外显子的大小依次为118bp、305bp。
2将Bx-ttl基因推测的氨基酸序列在NCBI上进行BlastX检索,发现它与多种线虫的类甲状腺转运蛋白基因同源。结果显示和其同源较高的是猪蛔虫Ascaris suum、秀丽小杆线虫Caenorhabditis elegans、C.briggsae和穿孔线虫Radopholus similis,与猪蛔虫编码的Transthyretin-like protein5(登录号:ADY49039)以及C.briggsae CBG(登录号:XP_002641774)最大相似度都为47%,与穿孔线虫(登录号:AM691117)Rs-ttl-1最大相似性为46%,与马来丝虫(登录号:XP_001896770)相似度较低37%。
3原位杂交结果显示,Bx-ttl基因在松材体内分布范围在食道腺和食道。Southernblot结果显示Bx-ttl在松材线虫为多拷贝,至少存在5个同源基因。
4利用双链RNA浸泡的方法对松材线虫的Bx-ttl基因进行沉默试验。结果显示,干扰对繁殖率4d有影响。双链Bx-ttl处理线虫的繁殖率相对双链gfp处理的线虫减少了53%,干扰8d后,双链Bx-ttl处理线虫的繁殖率相对双链gfp处理的线虫减少了17%,差异不显著。干扰48 h后实验组,对照组虫数都有死亡,但差异不显著。
本研究为松材线虫的基因功能组学打下基础,为进一步寻找防治和控制松材线虫的方法提供了新的理论依据。