延边地区单核苷酸多态性与原发性肝癌预后的关联性研究

来源 :延边大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zibzibzib
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研究背景:原发性肝癌(Primary hepatic carcinoma,PHC)是一种在全球范围内发病率和死亡率都较高的恶性肿瘤,一般被简称为肝癌。因原发性肝癌恶性度高、侵袭能力强和预后差的特点,其死亡率一直居高不下,又因临床表现不明显,经常被误诊,错过最佳治疗时间,失去手术的机会。所以对高危人群的监测筛查,努力做到早期发现、早期诊断、早期治疗是改善肝癌患者的预后和减少死亡率的最有效办法。临床上肝癌的主要检查手段有影像学检查、病理学检查和肝癌肿瘤标记物检查。治疗方法主要有手术切除治疗、肝脏移植、肝动脉化疗栓塞术(Transcatheter arterial chemoembolization,TACE)、局部消融治疗、放射性治疗、靶向治疗、中医中药治疗和对症治疗等。目前对于PHC的诊断和治疗虽然已经有了成熟的体系,但在实际临床治疗中仍会遇到选择治疗方法时缺乏判断预后效果依据的问题。现代社会由于核酸(分子)层面的技术日益成熟,人类基因组计划的完成,人们愈加重视探索肿瘤与基因之间的关系并发现单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)作为最常见的基因多态性可作为判断肝癌患者预后的判断依据。研究目的:分析SNP与延边地区PHC患者预后的相关性,为寻找预测PHC患者预后的标志物提供理论依据。材料与方法:1.与肝癌患者预后相关SNP位点的选择:利用TRANSFACR(?)预测软件、Regulome-DB数据库筛选出有可能与肝癌有关的SNP位点,利用NCBI-SNP数据库筛选出中国地区次要等位基因频率>10%的SNP位点。2.患者的选择与样本提取:建立系统的纳入标准,收集2010年10月~2018年12月期间在延边肿瘤医院和延边大学附属医院接受过治疗且符合纳入标准的PHC患者共369例。请患者签署知情同意书,详细记录患者各种临床资料,在患者进行放、化疗之前收集新鲜血液样本。使用全血核酸提取仪提取血液中DNA样本。使用分光光度计对提取的DNA样本进行检测,未达标的样本进行重新提取或者进行删除。3.基因分型:设计引物,利用PCR-RFLP技术对提取的DNA样本进行酶切与电泳,通过酶切产物的长度与数量判断SNP位点的基因型。4.统计学分析:利用统计学软件分析各种临床资料与PHC患者预后的关系,分析SNP位点基因型与PHC患者的预后关系。结果:1.rs970797位点与PHC患者预后相关:通过查询数据库和Cox回归分析发现众多位点中rs970797位点中国人群次要等位基因频率为0.402,且与PHC患者预后相关性具有统计学意义。2.各种临床特征与PHC患者预后的关系:通过369例PHC患者的临床资料及病理特征与死亡率和总生存期之间的相关性分析结果表明:患者是否有肝炎病史、患有肝炎的类型、每日酒精摄入量、肿瘤的临床病理分期和患者是否接受过辅助治疗对PHC患者死亡率和总生存时间的影响具有显著意义(log-rank P<0.05),而年龄、民族、性别、饮酒情况和吸烟情况对PHC患者死亡率和总生存时间的影响没有明显的统计学意义(log-rank P>0.05)。3.rs970797基因型在不同亚组的分布情况:卡方检验显示rs970797位点的三种基因型(CC、CA、AA)与年龄、民族、性别、饮酒状况、吸烟情况、肿瘤病理分型以及接受辅助治疗情况等均无统计学意义。4.rs970797基因型对患者预后的影响:Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析显示:AA型基因可作为PHC患者预后的保护性因素,在变体A等位基因的隐性模型下HR=0.709,95%CI=0.508-0.991,P=0.044。在共显性模型下 HR=0.697,95%CI=0.486-1.001,P=0.05)。5.多因素分析:多因素Cox回归分析显示rs970797AA基因型、低肿瘤病理分期情况和接受辅助治疗是肝癌患者预后的保护因素(HR<1,P<0.05)。6.rs970797次要等位基因频率在全球不同地区人群的情况:rs970797位点的次要等位基因频率为0.33,通过查询NCBI数据库发现该值与“千人基因计划”中其他地区相比处于较低水平,远低于全球平均水平0.42。7.事后亚组分析:将患者按年龄、性别、民族、患肝炎情况、吸烟情况、饮酒情况、接受辅助治疗情况分成亚组,然后统计分析发现:在这些亚组中携带rs970797AA基因PHC患者与携带CC和CA基因型PHC患者的风险比分别为:男性组为0.671(P<0.05),朝鲜族组为0.618(P<0.05),有肝炎病史组为0.658(P<0.05).,吸烟组为 0.532(P<0.05),饮酒组为 0.592(P<0.05)。结论:1.单核苷酸多态性rs970797(C/A)可能与延边地区PHC患者的预后具有相关性,拥有rs970797A型基因的PHC患者拥有更长的总生存期与更低的死亡风险。2.肝动脉化疗栓塞术(TACE)辅助治疗可有效地延长肝癌患者的总生存期、降低死亡风险。3.每日酒精摄入量可能与延边地区PHC患者的预后具有相关性,每日酒精摄入量高的PHC患者总生存期更短、死亡风险更高。
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