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猪繁殖与呼吸综合征是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的一种以母猪繁殖障碍和仔猪呼吸道疾病为特征的传染病。该病自发现以来给世界各国养猪业造成了巨大的经济损失。2006年夏秋之季,我国部分地区发生猪“高热病”疫情,对养猪业造成巨大损失,发现了高致病性猪繁殖与呼吸综合征变异病毒,证实疫情主要是由该病毒引起的。本研究通过RT-PCR技术对2006月年至2008年2月送检的56份病料进行PRRSV检测,结果30份为阳性,阳性率达54%。本实验对这30份阳性病料作为研究对象,根据北美洲株ATCC-VR2332和中国标准株CH-1a的序列利用Primer设计一对针对ORF3基因的特异性引物GP3-1/GP3-2,通过RT-PCR扩增出约900bp的基因片段,与预期的目的片段大小相符。将其插入克隆载体质粒pMD18-T。构建重组质粒,对克隆的ORF3基因进行序列测定,测序结果显示ORF3基因全长765bp。包含完整的ORF3基因的开放阅读框架,编码254个氨基酸。将ORF3基因序列与VR-2332、FJ04A、JXA1、HuN、LV、VR2332、RespPRRS MLV和CH-1a的ORF3基因进行同源性比较,结果显示,30份毒株的ORF3基因序列之间的核苷酸同源性为90.8%～99.9%,推导编码的氨基酸序列之间的同源性为92.6%～100%;与VR-2332、FJ04A、JXA1、HuN、LV、RespPRRS MLV和CH-1a株的核苷酸同源性分别为87.9～90.0%、89.4%～90.7%、92.1%～99.7%、91.9%～99.4%、40.7%～41.2%、88.2%～89.6%、93.1～96.7%。与VR-2332、FJ04A、JXA1、HuN、LV、RespPRRS MLV和CH-1a株推导编码的氨基酸序列之间的同源性分别为90.2～92.5%、91.3%～93.8%、93.0%～99.7%、93.8%～99.6%、54.9%～56.9%、90.2%～92.5%、95.9～97.6%。表明国内流行毒株的ORF3基因区域变异较大,证实30份毒株均属美洲型。把30株流行毒株与国内外已发表的48株PRRSV相应序列进行比较,并建立了遗传进化树。本研究获得的30株流行毒株均属于3个亚群中的亚群Ⅱ,并且ORF3基因序列的同源性和2006至2007年“高热病”期间分离得到的国内代表株较高,达到了97.7%～99.7%。推导编码氨基酸的比较结果表明,分属于不同亚群的广西不同地区流行的PRRSV毒株在ORF3基因编码蛋白的潜在糖基化位点数7个。分别位于29aa、43aa、50aa、131aa、152aa、160aa、195aa。本研究通过对PRRSV ORF3基因序列变化的比较,了解PRRS的流行状况,探索高致病性猪繁殖与呼吸综合征变异病毒的变异规律,为控制本病流行打下基础。