micro RNA(mi RNA)是由21~23个核苷酸组成的一种非编码小分子RNA。它在生物体内通过降解靶m RNA或阻遏靶m RNA翻译调控基因表达,调控生物体细胞的生长、分化、凋亡等生物过程。已经有研究证实,细菌、病毒的mi RNA在人体存在着跨界调控。近年来有研究发现植物mi RNA可以通过摄食进入并稳定存在于人体中,且保持其生物活性,使得外源性植物mi RNA是否对人体产生跨界调控成为mi RNA研究领域的热点问题。为探究植物mi RNA在人体中可能存在的跨界调控作用,本文基于公开发表的数据对人体外源性植物mi RNA进行挖掘,其中包括对已经实验证实的人体外源性植物mi RNA的数据以及目前人体血清的高通量mi RNA测序数据。对于高通量数据,本文首先通过预处理过滤掉低质量数据,其次通过与植物mi RNA序列比对,获得存在于人体的外源性植物mi RNA。最后在数据分析的基础上,本文共得到54条存在于人体的外源性植物mi RNA,并以这些获取的54条外源性植物mi RNA进行植物-人体的跨界调控分析。所谓植物-人体的跨界调控分析,就是建立植物-人体跨界调控模型。首先对外源性植物mi RNA进行外源性植物-人m RNA全基因组靶基因预测及筛选。其次,基于经过两次筛选得出的靶基因建立调控网络,并基于基因节点间存在的相互作用关系计算节点网络权值,选取核心节点。最后,对核心节点进行网络核心模块挖掘,分析核心模块涉及的调控通路和参与的主要功能,即找到外源性植物mi RNA在人体中可能存在的调控作用。本文通过植物-人体跨界调控模型,挖掘出9个核心模块,分别是AXIN1,HOXB1,ATP5D,MAPK8IP2,ZAP70,MTNR1B,GPR35和GYS1。结果表明,外源性植物mi RNA参与调控人体胺代谢、酒精代谢以及脂肪酸代谢等生物过程。由此可见,饮食习惯的不同,可能对人体的健康和生理机能产生影响。本文为通过高通量数据分析发现人体内外源性植物mi RNA提供新方法,对于中国传统中草药mi RNA的治疗模式具有理论的指导意义,可以从本质上揭示植物的营养价值,对进一步研究人类健康与日常饮食习惯的关系具有重要意义。