随着我国社会主义市场经济制度的不断发展、完善和成熟,企业逐渐成为科研创新的主体,企业开展科研项目也是企业提升竞争力、增加经济效益和实现发展的重要途径,企业的科研创新具体由一个个的科研项目来实现,科研创新是实现企业发展和我国发展方式转变必由之路。从NS公司在科研项目管理中遇到的问题出发,结合项目管理理论和科研项目的特点,用理论和实践相结合的方法,探讨市场经济条件下中小企业科研项目管理中的对策和具体科研项目管理能力的建设问题。本文首先通过考察NS公司某国家科技计划项目,分析项目立项和项目实施过程,比较项目目标和项目实施结果之间不匹配的差异,依据项目管理理论和项目可行性研究理论分析科研项目管理中的主要问题、表现形式及产生的原因,分析选择项目最佳目标和最佳方案,项目在技术可行性、经济上的合理性等科研项目管理中存在的问题,最后探讨如何改进和提升企业的科研项目管理能力。