吴澄生活在宋元之际。宋元之际既有理学的流行,也有心学的发用,所以他的哲学思想具有双重特点,既吸收了理学的精华,也看到了心学的长处。他把这两种学说经过损益之后融会贯通,形成了自己独特的哲学风格。吴澄的哲学思想包括理学、心学和工夫论三部分内容。吴澄在求学过程中就显示出兼收并蓄的特点。但其哲学思想是以朱熹的理学为基础的,在此基础上融合了陆九渊的心学。在介绍吴澄理学思想的时候,从“理气论”、“太极说”和“性情论”三方面入手。朱熹学说对吴澄影响很深,他的哲学思想的基础来自朱学。其实不仅仅是朱熹学说影响了吴澄,中国哲学史上其他著名理学家的思想也在吴澄的哲学体系中能观察到踪迹,所以吴澄所研究的哲学内容也逃脱不出理气、心性、善恶等基本的哲学命题。吴澄的哲学思想中的心学理论一方面弥补了理学的不足,强调不仅仅要注重外部世界的作用,还要重视本心的发用；另一方面,也把心学拉出了偏向于虚空和玄学的尴尬境地。心学和理学虽理论基础不同,但毕竟同属儒学的范畴。所以有些共同的命题是这两个学派都非常感兴趣,而且讨论非常多的。吴澄的学说当然也不能逃开这些命题,但吴澄的研究带有鲜明的自身特色,即在讨论这些范畴和命题的过程中融合朱陆学说。使自己的研究既具有很高的理论水平,又具有很好的践行效果。吴澄学说宗朱兼陆的鲜明特点,以及他对理学和心学的融会贯通所做的贡献,使得他的学说在宋元时期产生了很大的影响,被当时的学者所推崇。不仅如此,他融汇理学和心学的这种做学问的思路还启发了宋明理学后期的集大成者王阳明,而且还对清代考据学也产生了积极的影响。