宫颈癌中ΔNp63α的LncRNA表达谱及其抑制LIF表达的分子机制

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研究背景作为p53家族的成员,p63根据其N端转录激活区不同分为TA型和ΔN型,根据转录本3’端的选择性剪切产生不同的C端,至少包含6种亚型TAp63a,TAp63β,TAp63γ,ΔNp63a,ΔNp63β,ΔNp63γ[2-4]。p63是诱导基底细胞分化的重要调控基因,并且特别是在上皮分层和终末分化过程中。本课题组前期研究结果发现,ΔΝp63α是宫颈上皮组织中主要的表达亚型,在低分化的宫颈鳞癌中表达量低。LncRNA是一类大于200个核苷酸的非编码RNA[24]。因与肿瘤的紧密关联而备受瞩目。LncRNAs可以在各种水平上调节基因表达,包括染色质修饰,转录和转录后调控。LncRNA的异常表达会引起癌症的发生和进展,包括乳腺癌,肺腺癌和宫颈癌。本研究的目的是探讨子宫颈癌中ΔNp63α的LncRNA表达谱。通过分析这些筛选出mRNA和LncRNA,来构建ΔNp63α调控上皮增殖和分化的调控网络。方法通过慢病毒载体的构建和包装体系,构建了ΔNp63α稳定表达的SiHa细胞系及其对照细胞,分别命名为SiHa/ΔNp63α和SiHa/con。通过对SiHa/ΔNp63α细胞系及其对照细胞进行芯片测序,检测出有明显表达差异的mRNA和LncRNA。通过qRT-PCR在SiHa/ΔNp63α细胞系和瞬时沉默ΔNp63α的ME-180的细胞中多次验证候选序列,筛选出与ΔNp63α有明显相关性的mRNA和LncRNA,并对其进行分析。结果1.通过ΔNp63α的LncRNA表达谱分析和qRT-PCR验证,我们筛选出9个与ΔNp63α具有相关性的LncRNA,包括ENST00000447565(Lnc-LIF-AS),TCONS00012062,ENST00000570197,ENST00000563036,TCONS00011964,ENST00000439517,TCONS00004869,TCONS00014003,ENST00000469965。2.对这些LncRNA的UCSC分析之后,我们发现了由Lnc-LIF-AS和ΔNp63α共同调节的靶基因白血病抑制因子(Leukemia inhibitory factor,LIF)。ΔNp63α可在转录水平直接抑制LIF的表达,并通过抑制Lnc-LIF-AS的表达间接抑制LIF的表达。3.Lnc-LIF-AS通过与LIF mRNA的3’端的重叠区,吸附可能降解LIF的非编码RNA,促进LIF基因的表达。结论1.ΔNp63α通过下调Lnc-LIF-AS来间接抑制LIF的表达;2.ΔNp63α通过直接结合作用抑制LIF的转录,3.Lnc-LIF-AS与LIF mRNA的3’端UTR区重叠,吸附可能降解LIF的非编码RNA,促进LIF基因的表达。
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