近年来，随着金税二期工程的全面实施，增值税专用发票管理工作日趋完善，与此同时，税务机关对于除增值税专用发票以外的增值税抵扣凭证的管理也大大加强，陆续实现了电子采集和全国一级稽核比对。而此时，初级产品的增值税政策成为征管的难点。作为增值税一般纳税人的农产品收购企业，可以自行开具收购凭证作为增值税抵扣凭证。这本是一项“以人为本”的惠民政策，却给不法分子打开“方便之门”，使少数企业偷骗税成为可能。由于农产品收购凭证的销售方为千家万户的农民，采用企业自开自抵的方式，无法实现交叉稽核比对，目前仅采取了纳税评估等方式监管，远不能从根本上解决农产品增值税管理中存在的问题。本文正是针对这些问题展开论证，并对问题的成因进行深入的分析，最后提出具有实际意义的改进设想。　　 本文在第一部分主要介绍农产品增值税管理的背景和现状，介绍了我国农产品增值税管理政策的背景和沿革，对增值税准予抵扣的进项税额项目及管理流程进行了详细分析，客观地分析了农产品增值税管理现状，充分证明农产品抵扣是增值税管理中的最薄弱环节。通过这一部分论述，在介绍农产品增值税管理背景和现状的同时，也体现出加强和改进农产品增值税管理的必要性和紧迫性。　　 第二部分阐述我国现行农产品增值税管理中存在的问题和成因，并从增值税制度、税务部门监管、纳税人角度分别予以归纳、分析。从增值税制度看，现行农产品增值税管理流程违背了国家政策的初衷，还造成增值税缴纳的上、下环节脱节，并出现了增值不缴税的问题，继而导致农业产品进项企业税负异常。从税务部门监管看，无法对购销行为进行有效的监控，农业产品生产者身份难以界定，农业产品收购凭证开具真实性难以掌握，农产品收购凭证管理滞后；从纳税人角度看，购销双方无任何制约关系，税制缺陷与监管困难极易诱发偷骗税案件及虚开案件的发生，为企业调节税款和偷骗税提供可乘之机。最后，结合以上问题进行了案例分析。　　 第三部分内容是国外农产品增值税管理措施及经验借鉴，首先介绍了对农产品征收增值税的欧盟国家农产品相关增值税制度和管理方式，然后结合我国现状，提出可借鉴的国外经验。　　 第四部分给出农产品增值税管理模式的改进设想，按照操作细节和现实意义分别按短期措施和中长期措施分别阐述，包括定期开展纳税评估工作、加强日常管理和改进税制等措施，并选取了税务机关在实践中的实用纳税评估方法和经典案例进行了介绍。