我国早期的财务预算管理理论来源于西方经济学,西方经济学家在该领域的研究与实践已有近百年的历史。大多数跨国公司借鉴西方财务预算管理思想和方法来制定本企业的财务预算管理制度,作为企业管理的控制手段和绩效评价的依据。高新技术企业将财务预算管理做为企业管理的基础工具也经历了相当长时间的探索和发展,并在一些大中型高新技术企业中应用和推行,取得了一定的效果。但仍有很多企业在推行过程中出现了诸多问题,因难以及时解决,故未能实现预期的效果。如何使财务预算管理在高新技术企业发挥更好的作用,使理论更好的应用在实际工作中,是管理者需用急待解决的课题。本文依据所研究的高新技术企业财务预算管理理论和方法,通过具体的案例来分析和解决高新技术企业财务预算管理存在的问题,阐述构建高新技术企业的财务预算管理体系理论在实践中的应用。本文首先通过定义、特征及体系要素三方面对财务预算管理进行概述,使人们对财务预算管理有了初步的了解。然后再将战略管理理论、委托代理理论及内部控制理论引入到财务预算管理体系中,通过各个视角为财务预算管理体系在企业管理活动中的应用提供了坚实的理论基础；同时,在对财务预算管理理论基础进行分析,论证了高新技术企业财务预算管理的必要性。其次,通过对高新技术企业财务预算管理特点的介绍,加深人们对研发费用的认识及在高新技术企业中所隐含特有的现金流等经营风险。再次,从财务预算管理组织体系和财务预算管理流程两方面入手,阐述高新技术企业财务预算管理的体系搭建与实施的方式方法。财务预算管理组织体系是由两个方面组成：①高新技术企业财务预算的管理主体②高新技术企业财务预算管理的执行主体。在财务预算执行组织方面,将财务结算中心引入到传统的责任中心。同时,根据财务预算管理流程,从执行体系、目标体系、方法体系和考评体系等四个方面予以改进,构造出与信息技术、组织变化相适应的高新技术企业的财务预算管理体系,更有效的指导管理实践。最后,通过对JFHX高新技术企业财务预算管理体系的建立与实施,更好的说明了财务预算管理体系在高新技术企业中所产生的作用及实现的价值。