ITSN1在乳腺癌预后预测中的作用及其参与调控的分子网络分析

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目的Intersectin(ITSN)作为一种高度保守的多结构域细胞衔接蛋白,主要参与胞吞,胞吐,肌动蛋白细胞骨架重排等生物学过程。除此之外,多项研究发现ITSN1还与多种疾病的发生密切相关。目前关于ITSN1与肿瘤的研究大多数围绕中枢神经系统恶性肿瘤,ITSN1参与调控恶性肿瘤的增殖、迁移和侵袭多方面功能,关于ITSN1蛋白在外周系统恶性肿瘤中的作用研究较少。乳腺癌是一种异质性很强的外周系统恶性肿瘤,严重威胁着女性的身心健康,因此探究与乳腺癌预后相关的分子靶点将对其治疗有很大的意义。基于此研究现状,本研究利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析ITSN1 m RNA表达水平与乳腺癌患者预后的关系,并采用多个数据库分析ITSN1在乳腺癌中的表达水平,对与ITSN1具有相关性的基因进行信号通路和生物学过程富集分析。本研究将为进一步研究ITSN1在乳腺癌中的作用提供理论基础,并为乳腺癌的治疗提供新的思路和方向。方法使用Kaplan-Meier Plotter数据库在线分析ITSN1 m RNA表达水平与不同亚型及临床病理特点乳腺癌患者预后的关系;利用GEPIA数据库和CCLE数据库分析ITSN1,HER2和ESR1在乳腺癌等多种肿瘤中的表达;利用GEPIA数据库分析ITSN1,HER2和ESR1在乳腺癌和正常乳腺组织中的表达;利用EMBL-EBI数据库分析ITSN1,HER2和ESR1在不同类型乳腺癌,乳腺癌临床样本,不同乳腺癌细胞系中的表达;最后利用Linked Omics数据库分析与ITSN1具有相关性的基因,并对这些基因进行信号通路和生物学过程富集分析。结果1.ITSN1 m RNA高表达的乳腺癌总人群有更好的预后。在不同类型的乳腺癌中,ITSN1 m RNA的高表达预示luminal A,luminal B,HER2阴性,组织学Ⅰ级以及淋巴结阳性乳腺癌患者更长的无复发生存,ITSN1 m RNA高表达的淋巴结阴性乳腺癌患者具有更好的总生存。2.在细胞分化较差(组织学Ⅱ级和组织学Ⅲ级)的乳腺癌患者中,ITSN1 m RNA的表达水平不能预测患者的预后。3.ITSN1 m RNA低表达的HER2扩增型乳腺癌患者或ER阳性乳腺癌患者有更好的总生存。ITSN1 m RNA低表达的HER2阳性乳腺癌患者或ER阴性乳腺癌患者有更长的无复发生存。4.ITSN1 m RNA的表达量对不同孕激素受体乳腺癌患者的预后无显著影响。5.进一步分析发现,ITSN1在乳腺癌中的表达降低,ESR1和HER2在乳腺癌中的表达升高。6.ITSN1在Luminal型乳腺癌中的表达最高,在三阴性乳腺癌中的表达次之,在HER2阳性乳腺癌中的表达最低。7.ITSN1在大多数原发性乳腺癌中的表达低于正常乳腺组织,在乳腺癌样本中的表达水平较低,在不同乳腺癌细胞系中的表达水平也较低。HER2和ESR1在大多数原发性乳腺癌,乳腺癌样本,乳腺癌细胞系中的表达水平较高。8.共有9733个基因与ITSN1具有相关性,ITSN1与HER2,ITSN1与ESR1之间的表达具有相关性。9.与ITSN1具有正相关的基因在PI3K-Akt信号通路,松弛素信号通路,PPAR信号通路,肌动蛋白细胞骨架重排,细胞粘附,细胞迁移,细胞运动和细胞定位,钙离子结合,细胞骨架蛋白结合,细胞粘附分子结合,信号受体结合,粘着斑,细胞-基底连接等方面具有富集。10.与ITSN1具有负相关的基因在错配修复,基因复制,核苷酸切除修复,嘧啶代谢,RNA降解,细胞周期,药物代谢,嘌呤代谢,核酸转运,RNA加工,RNA剪接,m RNA加工,RNA结合,药物结合,核苷酸结合,染色体区域,核仁,核膜,细胞膜等方面具有富集。结论1.ITSN1 m RNA高表达的乳腺癌总人群具有更好的预后,但ITSN1 m RNA低表达的HER2扩增型/阳性乳腺癌患者及ER阳性乳腺癌患者的预后好于高表达组。2.ITSN1在乳腺癌中的表达低于正常乳腺组织,HER2和ESR1在乳腺癌中的表达高于正常乳腺组织。3.与ITSN1具有相关性的基因参与调控PI3K-Akt信号通路,肌动蛋白细胞骨架重排,细胞运动,错配修复,基因复制,核酸代谢,RNA加工等多种过程,这些过程都与肿瘤发生密切相关。
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