基于HQSAR、CoMFA、CoMSIA三种技术的QSAR分析

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在环境生态毒理学研究中,有机污染物的定量结构-活性相关(QSAR)分析技术一直担任着重要的角色。由于化学品数量的飞速增长,人们需要对化学品进入环境后对环境的影响作出正确的判断和预测,同时,又需要在人力物力允许的范围内进行研究,这就需要掌握具有较强的模拟能力和预测能力的研究方法,QSAR技术正可以满足这一要求。经过人们数十年的努力,已经发展并应用了许多成熟的QSAR方法,如Hansch方法、LSER方法、Free-Wilson方法等。随着计算机技术的飞速发展,以及人们对于定量结构-活性相关理论研究的不断深入,在上世纪后期,出现了数种基于计算机软件的全新QSAR技术,比较典型的有全息定量结构-活性相关(HolographicQSAR,HQSAR)技术,比较分子力场分析(ComparativeMolecularFieldAnalysis,CoMFA)技术,以及比较分子相似指数分析(ComparativeMolecularSimilarityIndicesAnalysis,CoMSIA)技术。它们具有如下几个突出的特点:简便的操作性能、快速高效的统计能力、优异的预测作用、图形的直观表示。 本工作系统研究了HQSAR、CoMFA、CoMSIA这三种技术在环境生态毒理学中的具体应用,详细介绍了三种技术的理论基础和具体操作过程,着重讨论了各项参数的选择和改变对每种方法计算结果的影响,通过合理的优化途径提高了它们的计算能力和预测能力。另外,通过选择数个不同的毒性数据集,强调了这三种方法在环境生态毒理学领域的广泛适用性和应用前景。 本文的主要研究工作包括:(1)使用HQSAR技术分析了30个酯类化合物对四膜虫(Tetrahymenapyriformis)的半数生长抑制浓度(IGC50),讨论了色码的作用; (2)使用HQSAR技术分析了61种苯类衍生物fetheadminnow(Pimephalespromelas)的水生急性毒性LC50,并有效预测了测试集中8个苯类衍生物的急性毒性; (3)使用CoMFA技术分析了49种五倍子酸衍生物的麻醉活性ID50; (4)使用CoMSIA技术分析了部分环境优先污染物(包含卤代苯类、苯胺类、苯酚类、硝基苯类)对虹鳉(Poeciliareticulata)的水生急性毒性LC50。
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