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鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma, NPC)是我国南方地区相对高发恶性肿瘤，进行NPC发病、诊断和治疗方面的研究意义重大。 NPC血清蛋白质组学研究可以发现NPC相关血清蛋白质，其研究成果最终可应用于NPC的临床诊断、病程监测、疗效监控和治疗等多个方面，具有现实意义和应用前景。 目前关于NPC蛋白质组学研究的文献报道多以细胞或组织为研究对象，血清蛋白质组学研究仅见一篇。 本研究在建立蛋白质组双向电泳(two-dimensional polyacrylamide gelelectrophoresis，2-DE)技术和优化各类实验条件的基础上，采用2-DE联合质谱(Mass spectrometry,MS)的技术路线进行了NPC血清比较蛋白质组学研究，通过比较NPC组(33例)和正常人组(36例)血清蛋白质2-DE图谱，找出差异蛋白质点，鉴定NPC相关血清蛋白质。 在进行两组之间蛋白质点差异比较分析时，采取了标本混合结合部分个体验证的策略。分别将两组标本等质量混合；两组混合样品分别进行2-DE；并随机抽取两组的部分个体标本进行2-DE；通过软件分析比较两组混合样品图谱，找出差异蛋白质点，选取在本组大部分个体标本中也同时出现的差异蛋白质点，作为最终质谱鉴定对象。标本混合的方法有效降低了个体差异所造成分析上的复杂性，综合提高了2-DE的重复性，提高了差异分析的准确性和通量。 在样品2-DE分析时，联合应用了三种不同pH范围的胶条(pH3～10NL、4～7、4.7～5.9，相互有部分重叠)进行差异分析比较，每种胶条至少重复三次；所发现的差异点中，有的在三种不同pH范围的胶条中均能检测到，大部分在两种胶条中均能检测到；这无疑显著增加了实验结果的重复性和可靠性。 通过本次研究，我们建立了重复和稳定性较好的血清蛋白质2-DE方法和血清白蛋白、IgG过滤去除的方法；首次比较NPC和正常人血清蛋白质2一DE图谱，初步分析出15个NPC特有血清蛋白点和1个NPC消失的蛋白点，其中质谱初步鉴定出3个NPC相关血清蛋白质，分别为sen卫n amyloid A Protein、MLL Protein伊raglnent)、G仰eyelohydrolaseltyPeW(F ragment)。为进一步研究奠定了良好基础。 所鉴定出的蛋白质有可能与NPC的发生、发展相关，也可能成为NPC潜在的标志物。