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目的:分析SD大鼠消化道不同部位乳酸杆菌的多样性方法:3只6周龄正常SD大鼠普通饲料喂养4周后,分别取喂养饲料、胃、小肠近端、小肠远端、大肠的粘液和内容物,提取细菌DNA,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法分析SD大鼠各个部位乳酸杆菌的多样性。结果:(1)用乳酸杆菌属通用引物LactoF/R对普通饲料及大鼠四个部位提取的细菌DNA进行PCR扩增,扩增后电泳显示,普通饲料没有条带,其余标本均有条带。(2)胃部三个16SrDNA部分可变区域基因文库中均得到9个相同的操作分类单元(Operational Taxonomic Unit, OTU,基因序列相似性大于98%),其中6个OTU属于可培养的乳酸杆菌属菌株,另外三个属于不可培养的细菌克隆子。(3)小肠近端三个16S rDNA嘟分可变区域基因文库文库中分别得到了10,9,10个OTU,样本1和样本3的10个OTU相同,样本2比样本1和3少了Uncultured Lactobacillus sp. clone BR15AD06。(4)小肠远端三个16S rDNA部分可变区域基因文库中分别得到了13,12,13个OTU,样本1和样本3的13个OTU相同,样本2比样本1和3少了Lactobacillus johnsonii CRL1452。(5)大肠三个16S rDNA部分可变区域基因文库中分别得到了10,11,9个OTU,其中样本1少了Uncultured bacterium clone PF4980,样本3中少了Uncultured bacterium clone ECN343e07和Lactobacillus intestinalis TH4。结论:(1)SD大鼠胃部、小肠近端、小肠远端、大肠四个部位的内容物及粘液均可检测到乳酸杆菌。(2)小肠远端乳酸杆菌菌种多样性最高,而小肠近端的乳酸杆菌均匀度最高,胃部乳酸杆菌多样性和均匀度均低于其他检测部位。