猪伪狂犬病病毒microRNA文库的构建及鉴定

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猪伪狂犬病(Pseudorabies, PR)是由伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus, PRV)所引起的一种高度接触性、急性传染病。PRV属疱疹病毒科(Herpesviridae),α疱疹病毒亚科,该病在全球范围内给养猪业造成了巨大的经济损失。近期研究表明,一些疱疹病毒编码的miRNA在病毒复制与调节中起着至关重要的作用。MicroRNAs(miRNAs)是一种含有约22个核苷酸的非编码单链RNA分子,广泛存在于人类及其它各种生物中。它通过与靶mRNA特异性的结合,引起靶mRNA降解或者抑制其翻译,从而调节基因的转录后表达水平。伪狂犬病毒编码miRNA的研究才刚刚起步,因此,对伪狂犬病毒miRNA的探讨具有重要意义和学术价值。本研究利用PK-15细胞培养猪伪狂犬病毒,接毒后在不同时间阶段收集病毒细胞培养物,分别提取不同时间段细胞培养物的总RNA;变性聚丙乙烯酰胺凝胶分离出18-26nt的小片段RNA,小RNA分子两端先后连接生物接头后进行反转录,PCR扩增后回收DNA片段;将所获得DNA片段与质粒载体连接,将连接产物转化工程菌,构建猪伪狂犬病病毒miRNA的cDNA文库。从阳性克隆菌落中随机挑取一些克隆,进行PCR扩增鉴定克隆的特性并测序,则得到20个大小正确的序列,结合生物信息学方法初步筛选出miRNA。实验结果表明,通过富集小分子RNA、反转录扩增小RNA分子,成功构建猪伪狂犬病病毒小分子RNA的cDNA文库。序列分析和伪狂犬病病毒生物信息学相结合,筛选出1个猪miRNA和1个伪狂犬病毒miRNA,其中也存在接头自连或编码RNA降解片段,证实体外培养的伪狂犬病毒在繁殖过程中有microRNA的生成和存在。伪狂犬病毒miRNA的cDNA文库的成功构建,为伪狂犬病毒miRNA的研究奠定了基础,但所建cDNA文库克隆数量级有限,因此,本实验涉及伪狂犬病毒microRNA的研究只是一个开端。
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