改进的“分子开关”技术在SNP位点CYP2C19*2和*3分型中的应用

被引量 : 0次 | 上传用户:seedvs18606
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
实验目的:氯吡格雷(Clopidogrel)属于吩噻吡啶类抗血小板药物,在临床上被广泛应用于心脑血管疾病的治疗,但临床上发现患者对氯吡格雷的药物代谢存在显著的个体差异,研究表明CYP2C19*2和*3位点的碱基多态性与药物代谢相关,因此对这两个位点的准确分型对指导氯吡格雷个体化用药有重要意义。本研究旨在建立一种灵敏度高、特异性强、操作方便并且可用于大量筛查的SNP分型方法,为指导氯吡格雷个体化用药打下基础。研究方法:1选择基于“分子开关”的SNP基因分型方法。设计3′末端硫代修饰的特异性引物结合高保真Pfu酶,用已知基因型的DNA为模板摸索最佳扩增条件,并探讨3′末端单硫代修饰和双硫代修饰引物对扩增特异性的影响,最终建立稳定的对CYP2C19*2和*3位点分型的方法。在此基础上,对104例外周血标本进行CYP2C19*2和*3位点进行基因分型,并与测序结果相比较,以进一步验证该方法可靠性。2鉴于单硫代修饰引物特异性不足的缺陷,探讨以Tth-SSB作为添加剂对反应特异性的影响。构建Tth-SSB质粒,在表达纯化出Tth-SSB后,首先确定其添加用于SNP分型的扩增体系中的最佳用量,在此基础上,考量其提高反应特异性的效果。最后将其用于CYP3C19*2和*3位点进行SNP分型,并与双硫代修饰引物结果相比较。同时还探讨了其他一些添加剂如二甲基亚砜、甜菜碱和海藻糖等对改进反应特异性的效果。研究结果:1建立了一种基于双硫代修饰结合高保真酶的SNP分型方法,利用该方法对104例外周血标本CYP2C19*2(681G>A)和CYP2C19*3(636G>A)的分型结果与平行测序结果一致,表明该方法简便、可靠,可用于临床指导氯吡格雷的个体化用药。2初步获得苏州地区CYP2C19*2位点三种基因型A/A、G/A、G/G频率分别为8.65%、36.54%和54.81%;CYP2C19*3位点三种基因型A/A、G/A、G/G频率分别为0.96%、9.62%和89.42%。3将1μg/25μL Tth-SSB添加到单硫代修饰引物的扩增体系后,可杜绝非特异性扩增,提高基因分型的准确性。Tth-SSB可以提高基因分型反应的特异性,并且对104例标本检测结果与双硫代修饰引物检测结果完全相同。4二甲基亚砜、甜菜碱、海藻糖添加到SNP基因分型扩增体系中,对提高特异性的效果不明显。结论:基于“分子开关”的SNP基因分型方法,高保真酶结合双硫代修饰引物,或者添加1μg/25μLTth-SSB的单硫代修饰引物的反应体系均可对CYP2C19*2(681G>A)和CYP2C19*3(636G>A)进行准确分型。该方法成本低廉、简单可靠,并可用于大量标本筛查,可推广至临床指导氯吡格雷个体化用药。
其他文献
唐挽歌以献赠的实用性挽歌为主,歌主多为皇室宗亲、达官显宦。皇室的挽歌歌题比较明晰可辨,即皇帝题以庙号、谥号或陵名,其他宗室贵族则多用谥号或封号,然官员却不然。唐朝官
随着电子工业的迅速发展,电子设备已经广泛应用于各个行业,并创造了越来越大的经济效益和社会效益。但电子设备在工作过程中不可避免地会受到各种形式机械力的作用,特别是振动和
管束干燥机是当今社会最先进的干燥机之一,其高效节能的特性适应了时代的发展,被人们广泛应用。本文概述了管束干燥机的管束装置所依据的设计标准,并结合工程实际对管束装置
钢铁企业备件供应商的评价与选择,是钢铁企业供应商管理的重要内容。钢铁企业生产过程的连续性、以及备件供应商分散性、质量严格性等特点,决定了钢铁企业备件供应商的评价与
在经历了多年的卫国战争之后,为了摆脱不发达状态,越南进行经济改革,不断加快经济增长与发展的步伐。近年来,越南社会经济起飞,自2000年以来保持着年均7%以上的增长速度。2009年在
在航空电子设备的结构设计中,CAE仿真分析是一个十分重要的阶段。而使用ANSYS平台的有限元分析方法,是最为重要的方法之一。本文主要使用有限元仿真平台ANSYS Workbench,针对某
随着经济全球化和知识经济时代的纵深发展,基层干部作为政府基层政权的核心人力资源,其素质的高低直接影响到基层政府的综合实力,基层干部的选拔则是为基层干部素质把关的第一道
现代电弧炉日趋向大型化、超高功率化发展,其关键控制机构如电极升降控制系统的稳定性和可靠性、控制精度和运行速度等指标对电弧炉实现缩短熔炼时间的,减少单位电能消耗,控
本文将流通创新内涵分解为流通规模、流通效率、信息技术(信息化水平)、流通结构和流通渠道五个不同的维度,并基于2005-2017年全国层面、东中西三个不同地区的面板数据,就流
当前大学英语课堂中缺乏对中国传统文化的介绍,学生学习英语,却很难用英语却介绍本民族的文化,导致文化"失语"。针对这种现象,本文将试着提出解决措施。