区域经济的全球化趋势,科技创新的区域化特色,体现了区域经济在世界经济的发展中正扮演着越来越重要的角色。相关经验表明,区域经济的发展能够有效地带动国家经济的发展,如美国硅谷地区的发展,我国中关村地区的发展等,就带动了本国经济的快速发展,这种现象正成为全球关注的焦点。因此,研究区域经济,对我国乃至世界经济的发展都有着重要的意义。在当今激烈的国际国内竞争背景下,区域竞争力的打造和可持续发展主要依托于区域的创新能力,区域创新能力的提高离不开健全、高效的区域创新系统,而区域创新系统只有与区域经济体进行有效地融合才能使其发挥应有的作用,否则区域创新系统只能停留在理论层面,而不具有实用价值。区域主导产业群是区域经济发展的代表,对区域经济的发展起着引领和推动作用,但区域主导产业群发展需要区域创新系统为其提供创新方面的支持,因此,两者互为要求,互相依赖,这是本文将区域创新系统与区域主导产业群联系起来,研究二者的协同发展的原因。本文先详细阐述了区域创新系统和区域主导产业群的相关理论,并分析了两者的关联关系。然后从功能要素和结构要素两个层面来研究两者的互动机理,在此基础上,运用协同学的相关理论对两者的协同机理进行了分析。之后,依据前文的理论研究,本文构建了基于模糊积分的区域创新系统与区域主导产业群协同绩效的评价模型,并对我国区域创新系统与区域主导产业群的协同发展的整体绩效做了相关的实证研究。最后从微观和宏观两个层面对如何推动两者的协同发展提出了相关的建议。