目的：通过了解福建省基层医务人员疟疾防治核心知识知晓情况及其影响因素，评估疟疾监测体系的敏感程度，为更有效地开展消除疟疾工作提供依据。对象和方法：对福建省84个县（市、区）所辖1291个乡（镇）卫生院、社区服务中心从事疟疾工作的临床内科、检验、疾控的医务人员进行有关疟疾基础知识、临床知识和预防知识的问卷调查。结果：本次调查的有效问卷为5128份，总体合格率为51.1%，总体优秀率为25.3%，基础知识的合格率为63%，临床知识的合格率为50.3%，预防知识的合格率为29.4%。疾控人员各项知晓率水平均高于临床人员。三明、南平两个地区的知晓率水平最高，厦门、漳州、泉州次之，莆田、宁德、龙岩、福州知晓率水平较低。影响疟疾防治知晓率的单因素分析结果显示，性别、年龄、职称、文化程度、工作年限、是否接受过培训对疟疾知晓率有一定影响。经多元Logistic回归分析，文化程度、工作年限、是否接受过培训对疟疾知识知晓率有影响。结论：基层医务人员对疟疾防治核心知识的知晓率还没有达到国家消除疟疾行动计划要求的目标，建议通过各种形式的培训和有效的宣传来提高疟疾防治知识知晓率，健全疟疾监测体系，以达到全国消除疟疾的目标。