近年来，随着高校科研实力不断加强，科研经费数量占高校总经费数量的比重越来越大，科研经费管理中存在的问题也日益显现。高校科研项目的成本核算普遍存在着要素不完整、人员经费核算不合理、科研间接费用挤占教育事业经费等问题，如何建立一个有效的成本管理体系来提高高校科研管理水平是目前高校科研管理所面临的一个重大问题。本文主要基于A高校的实际案例，针对A高校目前的科研经费管理现状，在充分借鉴前人研究成果和企业成本管理模式的基础之上，引入全成本核算思想，构建了一套基于作业成本思想的高校科研成本的核算模型。并且选取了A校的某一科研项目对该套计算模型进行了验证，以证实作业成本法计算模型具有一定的合理性和可操作性。本文旨在通过该套计算模型解决目前A高校科研经费管理中存在的问题，并为其他高校的经费管理提供借鉴。本文的创新在于提出了对我国高校科研项目进行全成本核算，并将作业成本法引入其中，较全面地反映了科研活动对高校资源的实际占用情况。同时，本文结合案例，设计出了一套较为系统的高校科研全成本核算方案，并验证了该方法的科学性和可行性，为大学科研项目的科学化管理提供一定的参考价值。