自金融危机以来,世界各国纷纷提出要大力培育和发展新兴产业,抢占经济和科技发展制高点,赢得市场竞争优势。通过与传统产业技术合作创新相比,发现当前的新兴产业技术合作创新呈现出资金投入大、知识含量高等特点,然而如何解决好合作创新中资金的高投入性、充分发挥好知识流动的超生态性等问题,已成为该领域亟需解决的重要课题。本文首先通过梳理国内外相关理论,明确了新兴产业、技术合作创新等相关概念,对比分析新兴产业与传统产业技术合作创新的异同,提出新兴产业技术合作创新存在资金的高投入性、知识流动的超生态性等特征。其次,绘制了新兴产业企业与高校、科研机构之间技术合作创新关系结构图,识别新兴产业企业与高校、科研机构技术合作创新过程中的委托代理关系。再次,基于委托代理理论、柯布道格拉斯函数理论、利益相关者理论等,以经典委托代理模型为基础,结合柯布道格拉斯函数理论,分别考虑资金的高投入性、知识流动的超生态性以及综合上述两特征的三种情形,构建基于改进的委托代理模型的产业技术合作创新模型,并运用算例分析对模型研究结果进行验证。研究表明:单独考虑资金投入比例系数和单独考虑超生态性系数时,资金投入比例系数的增加对技术合作创新的作用效果更佳,其主要表现在对高校与科研究机构的努力水平、激励强度系数、固定成本等方面的影响;同时考虑资金投入比例系数和超生态性系数时,其对激励强度系数的影响大于单独考虑超生态性系数对激励强度系数的影响,但是小于单独考虑资金投入比例系数对努力水平的影响。因此,新兴产业企业技术创新过程应重视资金投入以及加强创新主体间的交流合作。本文对新兴产业技术合作创新中资金的高投入性和知识流动的超生态性等新特征的探讨,一定程度上拓展了新兴产业技术合作创新理论研究;基于委托代理模型和柯布道格拉斯函数等构建改进的委托代理模型,结合算例分析,揭示资金的高投入性和知识流动的超生态性对新兴产业技术合作创新的影响机理,为新兴产业技术合作创新研究提供新的视角。在此基础上,本文提出的对策建议为新兴产业企业技术合作创新提供了决策依据,对于指导相关的技术创新实践具有一定的应用价值。