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1996年将水稻干种子作为模式研究材料搭载于返回式卫星返回地面后通过对突变体进行筛选和鉴定，获得了一批遗传稳定的诱变品系。以往通过双向电泳方法，发现空间环境能够引起诱变水稻蛋白质的改变，为了进一步研究空间环境引起诱变水稻遗传变异的蛋白质组的特点，本研究应用双向电泳技术和高效液相色谱技术，分别从不同灵敏度的角度扫描诱变水稻蛋白质组变化的特点，平行对四组分蘖旺盛时期空间环境诱变水稻与其地面对照不同变异性状的蛋白质的差异表达进行研究。 应用双向电泳技术和高效液相色谱技术对水稻材料研究得到了清晰的蛋白双向电泳图谱和指纹图谱，应用PDQuest软件和指纹图谱相似度软件对其进行分析，发现空间环境诱变突变体的蛋白质表达与地面对照相比，总数量有下降趋势。对表达量2倍上调、2倍下调和特异表达的蛋白质进行具体分析，表明空间环境产生的蛋白质组与原地面对照品种的蛋白质组差异程度，从蛋白质组角度证明了空间环境诱变产生了新的品种。 在971-5和971-4突变品系中发现的两个极端差异蛋白质点，经质谱分析和检索是与光合作用和能量代谢相关密切的蛋白质。 本试验应用双向电泳和高效液相色谱两种互补技术相结合的手段，研究空间环境诱变水稻蛋白质组变化，发现对双向电泳中难以鉴定的低丰度和疏水性强的蛋白，高效液相色谱能进行捕获分析，并证实双相电泳中缺失的蛋白实质是表达下调的结果，因此这两种方法结合起来能更为有效的对空间诱变水稻的蛋白质组学进行研究。