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通过野外现场调查和室内受控实验，对汕头南澳白沙湾和珠海桂山岛不同生态类型海域理化指标、浮游动物群落结构、沉积物休眠卵的分布与萌发等进行了研究，主要结果如下：1白沙湾浮游动物优势种为小拟哲水蚤、瘦新哲水蚤、短角长腹剑水蚤、竖长腹剑水蚤、大眼剑水蚤、小毛猛水蚤、尖额谐猛水蚤、根状拟玲虫。桂山岛浮游动物优势种为尖额谐猛水蚤、丽隆剑水蚤、小长腹剑水蚤、竖长腹剑水蚤、小拟哲水蚤。2白沙湾表层沉积物中TN、TP、TOC平均含量最高值出现在鱼类养殖区（1666mg/Kg、3245mg/Kg、1.49%），TN、TP平均含量最低值均出现在龙须菜栽培区（1000mg/Kg、679mg/Kg），TOC平均含量最低值出现在对照区（0.98%）。研究区域重金属污染属于低潜在生态风险，沉积物中Pb污染较为严重，富集系数在1-3之间，达到中等污染水平。鱼、贝类养殖区沉积物污染风险指数（30.2、28.9）高于对照区和龙须菜栽培区（27.1、20.4）。桂山岛表层沉积物中TN含量最高值位于渔船停靠区的S11（5900mg/Kg），TP、TOC含量最高值位于网箱养殖区的S8(2212mg/Kg、1.79%)， TN、TP、TOC含量最低值位于远离当地网箱养殖区的S3（600mg/Kg、204mg/Kg、0.79%）。研究区域重金属污染属于低潜在生态风险，Cu、Pb、Zn污染较为严重，富集系数均大于1。从空间上看，网箱养殖区和邻近市民生活区的海域沉积物污染风险指数（53.05）高于其他区域（34.97）。3南澳岛白沙湾表层沉积物中休眠卵对水体浮游种群的潜在补充量秋季（2012年10月）（9.44×10~5ind./m~3）高于冬季（2012年2月）（5.55×10~5ind./m~3），对照区和龙须菜栽培区高于鱼类养殖区和贝类养殖区；4个功能区垂直分布格局为：桡足类休眠卵在0～4cm层的潜在补充量相对较高，轮虫休眠卵6～8cm层的潜在补充量最高。桂山岛表层沉积物中浮游动物休眠卵对水体浮游种群的潜在补充量两岛连接处海域（4.9×106ind./m3）高于网箱养殖区和邻近市民生活区的海域（9.44×10~5ind./m~3）。表层沉积物在不同季节休眠卵数量不同，夏秋季节（8-11月）休眠卵的潜在补充量有减少的趋势，冬季（12月）潜在补充量有增加的趋势。4统计分析表明，白沙湾和桂山岛海域沉积物中休眠卵的数量与水深呈正相关。白沙湾表层沉积物中休眠卵数量及分布主要受养殖活动的影响，桂山岛沉积物中休眠卵数量及分布主要受地球化学成分变化的影响。5Cu、Zn、Cd三种重金属及温度、盐度、pH对休眠卵孵化有重要影响。随着Cu、Zn、Cd三种重金属浓度的增加和处理时间的延长，休眠卵孵化的幼体数量减少，沉积物中休眠卵死亡率呈明显上升趋势。在一定范围内，随着温度、盐度、pH的升高休眠卵孵化幼体数量增多，温度大于25℃，盐度大于30‰，pH大于8时不利于休眠卵孵化。6对桂山岛表层沉积物休眠卵孵化研究发现，休眠卵冷藏10个月比冷藏半个月孵化出的无节幼体数量多。海区原位萌发实验表明，表层沉积物在水深0.5m、1m、2m深处均有萌发，随着水深增加光照减少，休眠卵萌发量明显减少。