内部控制作为企业对生产经营活动和日产管理进行监督、制约、评价的一种手段，已经演化为农村信用社内部牵制和监督管理的核心手段。农村信用社作为特殊的集体企业，从一开始的管理混乱、内部控制形同虚设，到现在的扭亏为盈、各项监管指标良好、内部控制体系逐渐建立，已经经历了数十年的起伏变换。但是，由于历史的遗留、体制的畸变、管理上的缺陷，农村信用社在内部控制方面的问题日益凸显，而由于内部控制方面的问题所带来的核心竞争力和创造力不足、内部体制混乱、经营与服务理念落后等，制约着进一步的发展和改革。因此，研究内部控制在农村信用社经营管理方面的作用和改善内部控制存在的问题是有实际意义的，有利于企业的发展和长期竞争实力的形成。本文以山东东平农村合作银行（原东平县农村信用合作联社）为例，阐述了农村信用社内部控制方面的问题，科学地、定性的分析了农村信用社内部控制的先天不足和后天乏力。这些问题主要是体制和制度上的不健全、经营理念和认识上的不足、手段和经验上的落后以及管理上的问题。而这些问题的形成是有原因的，一方面，内部控制制度的建设需要符合企业实际的运用和设置，也要符合监管部门的监管要求和法律规范，要健全和完善内部控制制度体系需要一个长期的过程，而这也恰恰是内部控制现阶段的软肋。另一方面，体制的不健全和经营管理缺乏经验是导致目前农村信用社经营管理现状的直接原因，也就造成经营理念和认识上的不足以及手段和经验上的落后等问题。因此，摆在我们面前的问题已经很明显了，而如何很好的解决问题成为目前的一个困局。通过研究，单一的或是几个措施的实施并不能完全的、彻底的把内部控制很好的引上正确的轨道并发挥其作用，我们需要的是一个系统的、健全的、发展的内部控制体系的构建来解决这个问题。面对问题，我们建立了农村信用社内部控制的综合模型（ITM），并基于模型构建了全套的内部控制体系。由此提出了适合农村信用社当前实际的观点，主要是营造良好的内部控制环境；认识和化解经营风险；强化内部控制措施；加强内外部稽核监督。只有在这些观点和措施的共同协调、循序渐进、渗透发挥下，才能逐渐的引导内部控制发挥作用、推进企业的健康发展。总之，在理论和实践相结合的基础上，综合提升内部控制的有效途径，更好的服务与经营和发展，是我们此方面研究的夙愿。