P53是一种非常重要的抑癌基因，是生物学领域中研究热度最高的基因之一，并且该基因在维持基因组稳定性以及凋亡调控方面具有重要的作用．一旦野生型的p53发生突变，就会使人（或动物）体内的正常基因变为癌基因，因此，对P53的深入研究尤为重要.本文的主要工作包括以下几个方面：1、在已有的代数结构中，定义了密码子间的欧氏距离d，并用改进的变异系数法对欧氏距离进行加权，得到了密码子间的加权欧氏距离d*．分别用这两个距离对头颈癌中p53的突变情况进行了分析，结果发现新的加权欧氏距离d*能更准确的判断p53突变时其突变密码子哪一位碱基发生了变化．当d*大于1.5时，头颈癌中的p53突变密码子的第二位碱基发生了变化，并且能够改变其相应氨基酸的理化性质；当d*小于1.2时，头颈癌中的p53突变密码子的第一位或第三位碱基发生了变化，而这些位置上碱基的改变基本上不会改变其相应氨基酸的理化性质．研究结果表明，头颈癌中p53突变密码子的第二位碱基对氨基酸亲疏水性影响最大，第一位碱基对其影响次之，第三位碱基对氨基酸亲疏水性几乎没有影响．2、从GenBank中选取了七条最新的人类p53肿瘤蛋白的mRNA序列，对其偏好性进行了分析．利用MEGA4.0（MolecularEvolutionaryGeneticsAnalysis）软件对其做了同源性分析并得到同义密码子的RSCU值．为了更好的说明这七条mRNA序列的同义密码子的偏好使用性，计算了其QRSCU值．所选的七条mRNA序列的同源性达到了99.9%以上，相应的蛋白质序列的同源性在99.1%以上．通过分析和比较知道，基于拟氨基酸基因编码方法能更明显的展示出其对同义密码子的一致偏好性．p53基因发生突变时偏好使用以c/g结尾的密码子，其研究结果对其癌变基因和肿瘤基因的研究有一定的意义．3、对二十六条人类TP53,TP63以及TP73的mRNA序列及其蛋白质序列进行了分析，利用数学中模糊综合评价的方法通过建立隶属函数，讨论了以不同碱基（a,c,g,u(t)）结尾的密码子对p53以及其家族成员p63和p73的肿瘤蛋白的氨基酸亲疏水性的影响程度．结果表明：以碱基c结尾的密码子对TP53，TP63和TP73的氨基酸的亲疏水性的影响程度为非常强，以碱基u(t)结尾的密码子对其影响程度为强，以碱基g结尾的密码子对其影响程度为中，以碱基a结尾的密码子对其影响程度为弱．本文的创新点为：1、用改进的变异系数法求权重．2、定义两个密码子间的加权欧氏距离公式．3、通过同义密码子的RSCU值和QRSCU值的对比，QRSCU值更能显示出p53对同义密码子的一致偏好性．4、利用模糊综合评价的方法结合所选p53基因序列的特点建立隶属函数，对p53及其家族成员进行分析．