遗传性长QT间期综合征基因突变数据库的建立和对10个心律失常中国人家系致病基因的筛查

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摘要:长QT间期综合征(LQTS)是指具有心电图上QT间期延长,T波异常,易产生室性心律失常,尤其是端扭转性室速(TdP),晕厥和猝死的一组综合征。按病因可分为获得性和遗传性两种类型。获得性LQTS通常是由于心肌局部缺血,心动过缓,电解质异常和应用某些药物等因素引起的。而遗传性LQTS又可分为以下四种临床类型:Romano-Ward综合征(RWS),Jervell-Lange Nielsen综合征(JLNS), Anderson综合征(AS)和Timothy综合征(TS)。学者们从分子遗传学的角度揭示了QT间期的延长的发生机制:在心脏肌细胞动作电位3期,流向细胞外的钾离子流降低;或者流向细胞内的钠、钙离子流增高。总共有12个基因能导致LQTS,它们分别是:KCNQ1、KCNH2、SCN5A、KCNE1、KCNE2、KCNJ2、AKAP9、ANK2、CACNA1C、SCNA4B、SNTA1和CAV3。随着人们对遗传疾病发病机制认识的加深,近年来基因诊断技术开始在国外应用起来,并逐渐成熟和完善起来。根据NCBI网站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/GeneTests/?db=GeneTests)的统计,截止到2010/3/9为止,总计1658种遗传病的基因诊断已经在临床中应用,还有259种遗传病尚在实验研究阶段。基因诊断技术的应用和推广,发现了许多基因突变位点,产生了海量的数据信息。由于这些突变位点的书写格式是多种多样的,不便于数据交流和共享;因此,国际基因变异组学计划(HVP)于2008年制定了基于基因位点变异格式的数据库(LOVD)。而与LQTS相关的12种致病基因的LOVD数据库尚未建立,所以我们实验室建立了这种网上在线数据库。截止目前为止,我们总共登录了2976条记录,合计有1740种基因变异,其中950种基因突变有致病性,266种基因突变具有可疑致病性,293种基因变异为多态性(非致病性)位点和131种未归类的基因变异位点。我们的网站是:http://www.china-hvp.org/introduction/introduction.htm。该网站目前是关于LQTS基因变异最新最全的在线数据库,这些数据几乎囊括了所有已经发表LQTS相关基因变异的英文文献和中文文献。在第二部分的工作中,我们收集了10个疑似遗传性心律失常的中国人家系,其中6个家系为LQTS、2个家系为Brugada综合征和2个家系为病态窦房结综合征。对其中的先证者进行了KCNQ1、KCNH2、SCN5A、KCNE1和KCNE2基因测序检查。获得测序结果后,根据已经建立的LQTS数据库信息的对照和分析,我们发现了2个家系有致病性突变:KCNH2基因c.246252delATCGCGCAG和SCN5A基因c.3823G>A(已有文献报道);1个家系为剪切位点附近的新突变:SCN5A基因c.4296G>C(国内外未有文献报道);1个家系有疑似致病性突变:KCNH2基因c.2690A>C(文献对此位点是否具有致病性有争议)。剩余家系中,3个家系发现有氨基酸变异的多态位点:SCN5A基因c.3575G>A、SCN5A基因c.1673A>G和KCNE1基因的c.112A>G;1个家系携带有剪切位点附近的多态性:SCN5A基因c.1141-3C>A,其它的家系未发现异常。我们工作的创新处在于:1)第一次在世界范围内,建立了比较全面的、最新的基于LOVD格式的LQTS数据库;2)在对10个疑似遗传性心律失常的中国家系的基因检测中,发现了一个新的疑似致病性的突变位点。
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