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含有重复序列的样品在用ABI3730xl全自动测序仪测序时,容易发生测序信号终止、减弱或重叠峰的情况,导致测序失败。本课题对含有微卫星(短串联重复序列)的实验样品按其重复的特征分成单核苷酸微卫星、双核苷酸微卫星、三核苷酸微卫星以及多核苷酸微卫星四类,分别利用普通实验条件和优化的实验条件(改变测序PCR反应条件以及添加dGTP组份)进行测序,对测序结果比较研究。四组实验样品测序结果表明,将PCR反应退火时间增加至15s、延伸时间增至10s、反应循环圈数增至80cycles并添加dGTP组份的实验条件,对于含有复杂重复序列的样品测序效果最好,能够把普通实验条件测序不成功的样品测序成功。在本文所研究范围内的样品中,使测序结果的Quality值由57.8%提高到94.3%,效果十分理想,能够得到待测样品的核苷酸碱基序列。本课题对后人的测序工作有着重要的参考价值。