罗非鱼源自于非洲,上世纪80年代被引入中国并广泛养殖。由于罗非鱼适应力强,一旦从养殖场逃逸进入自然水体,会对当地物种多样性与生态系统造成破坏与威胁。2014年,罗非鱼更是被列入中国外来入侵物种名单。广西是中国养殖罗非鱼的主要地区之一。已有研究发现广西南部多条河流均有罗非鱼分布,并且已经建成种群。为深入了解这些河流中罗非鱼种群的杂交情况,本文对广西南部六条河流(红水河、右江、左江、黔江、郁江、浔江)的罗非鱼种群进行样本采集,提取其DNA,并对其mtDNA上的coⅠ基因与细胞核内的enc1、ptr、sh3px3三种基因进行PCR扩增,测序后利用同源性比对、系统进化树、遗传距离分析等方法,判断其中的杂合个体,并研究其杂合个体的分布规律。主要研究结果如下:(1)coⅠ基因同源性比对分析结果显示六条河流采集的496尾罗非鱼样本中,除了红水河合山87号、来宾11号样本的母本为杂合,其余所有罗非鱼样本的母本共有四种:尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、齐氏罗非鱼(Coptodon zillii)、莫桑比克罗非鱼(Oreochromis mossambicus)、奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus);其中齐氏罗非鱼为Coptodon属,而尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼、莫桑比克罗非鱼为Oreochromis属。尼罗罗非鱼在广西南部六条河流中分布最多,奥利亚罗非鱼在广西南部六条河流中分布最少。(2)三种核基因的系统进化树和遗传距离分析结果显示,496尾罗非鱼样本中,有91尾为杂合样本,杂合率18.3%。红水河、左江、黔江、郁江均存在罗非鱼大量杂交情况,右江存在少量杂交情况,而浔江没有发现杂交情况。杂交率高的地段多为中上游,杂交率低的地段多为下游,浔江位于其他5条河流的最下游,因而其杂交率为0%。在同一条河流中,通常齐氏罗非鱼比例越高,杂交率越低。除此之外,是否发生杂交还与栖息地、罗非鱼种群分布、水文条件等复杂因素有关。奥利亚罗非鱼在罗非鱼的杂交过程中占据了重要地位,其多与尼罗罗非鱼杂交;莫桑比克罗非鱼在罗非鱼的杂交过程中也占据了一定地位。sh3px3基因在罗非鱼的杂合鉴定中灵敏度很高,非常适合罗非鱼物种鉴定,通过该基因可鉴定出50%以上的杂合样本。(3)郁江横县、贵港和左江崇左均存在与纯合尼罗罗非鱼和纯合齐氏罗非鱼遗传距离都很大的样本,其遗传距离都在0.2000以上;这些特殊杂合样本的数量很多,共36尾,占据了杂合样本总数的40.0%。这些地点的罗非鱼已经出现与其他异属甚至异科鱼类发生杂交的情况,其中左江主要集中在中游河段,而郁江整条河均存在此情况。(4)除浔江外的五条河流野生罗非鱼普遍存在杂交现象,且罗非鱼杂交情况频繁,其中右江杂交情况暂处于初步阶段,而红水河、左江、黔江、郁江的杂交情况已经颇为严重。建议有关管理部门加强对野生罗非鱼的监管力度,并采取针对性措施降低罗非鱼种群的分布和扩散,并建立完善的本土鱼类保护机制,以保护广西南部河流鱼类资源多样性和生物完整性。