区域创新能力是我国经济进入新常态后区域经济发展的核心动力,但我国目前创新水平还比较低,且我国地域辽阔,各个地区之间的创新能力发展存在差异。本文从金融资本、市场规模两个角度入手,对金融资本、市场规模与区域创新能力三者之间的内在联系进行了实证研究。文章首先对区域创新能力、金融资本以及市场规模的相关概念进行了界定,并对已有的相关文献进行回顾和梳理,作为本文的逻辑起点。在实证检验中,本文选取了我国31个省2004-2014连续11年的面板数据作为研究样本,并建立联立方程模型对所提出的6个研究假设进行检验,并且在通过对单方程回归估计方法和系统估计方法的对比后最终选取了系统估计方法以消除不同方程间随机扰动项带来的误差。通过联立方程模型对全国层面样本数据进行回归估计,以及对东、中、西、东北四个地区的样本数据分别进行回归估计并比较其差异后,研究结果表明:(1)金融资本与区域创新能力之间是相互促进的,但金融资本对区域创新能力的影响主要体现在中西部地区和东北地区;(2)目前市场规模对区域创新能力有负面作用,区域创新能力对市场规模的影响则不显著,导致这一结果的原因是目前我国产业结构升级慢,第二产业中主要是劳动力密集型和资源密集型的加工制造业,在市场规模增加时企业会将精力集中于规模生产而对忽视创新活动。(3)金融资本和市场规模之间存在相互促进的关系,但这一关系主要体现在东部地区。最后本文针对全国层面金融资本、市场规模对区域创新能力的影响和地区间存在的差异提出了相关的政策建议。