本文首先对国内外有关技术创新、医药产业技术创新的研究进行了综述。其次对产业技术创新评价基本理论进行了研究，并针对医药制造业的特点对医药制造业的技术创新能力进行了研究。接下来，根据《2007中国高技术产业统计年鉴》的有关数据，从投入与产出两方面着手，对云南医药制造业现状及技术创新现状进行了分析。之后，分析了影响医药制造业技术创新能力的因素，建立了医药制造业技术创新能力的评价指标体系。利用统计数据，通过全局主成分法找出影响医药制造业技术创新能力的7个主因子。通过主成分分析和主成分得分的聚类分析结果，并综合现状分析结果得出云南医药制造业技术创新能力在7个主要方面得分值均较低，技术创新能力从1999-2006年呈“M”形起伏波动，综合技术创新能力处于全国落后水平，医药产业技术创新存在很多问题。具体存在的主要问题有：(1)科研经费投入与技术创新人力投入水平严重不足；(2)学术科研水平较低；(3)创新技术引进与技术改造水平不足，缺乏对外交流与合作；(4)技术创新成果市场转化能力严重低下；(5)技术创新科技活动经费内部支出结构不合理；(6)技术创新经济支撑力不足；(7)集聚程度低。最后，针对云南医药制造业技术创新方面存在的问题，对云南医药制造业的发展战略进行了定位，并给出了提升云南医药制造业技术创新能力的对策思路。