【摘 要】
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为探明miRNA在猪卵巢动态变化和发情周期中的调控作用,并筛选出一些重要的miRNA可被用于后续研究以提高母猪繁殖力,本试验采用高通量测序的方法,鉴定了约克夏母猪卵巢卵泡期(
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为探明miRNA在猪卵巢动态变化和发情周期中的调控作用,并筛选出一些重要的miRNA可被用于后续研究以提高母猪繁殖力,本试验采用高通量测序的方法,鉴定了约克夏母猪卵巢卵泡期(FP)和黄体期(LP)miRNA的表达谱及其差异性表达情况,预测其潜在的候选miRNA,并对miRNA的靶基因进行了GO富集分析和KEGG通路分析;挑选了重要的候选miR-214初步探索了其在发情周期中猪卵巢和颗粒细胞中的表达情况。主要研究结果如下:⑴对约克夏母猪黄体期和卵泡期卵巢小RNA文库进行了高通量测序。FP组共获得10-12百万条原始序列,LP组共获得13-16百万条原始序列。经质量处理后FP组共获得9-10百万条纯净序列,LP组共获得10-13百万条纯净序列,分别占到原始序列的77-93%和75-84%;⑵通过数据分析,本次测序在两组文库中共检出801个miRNAs,其中629个miRNAs在两组中共表达,73个miRNAs在LP组特异性表达,99个miRNAs在FP组特异性表达。差异分析发现共有112个差异表达的miRNAs,其中有25个miRNAs在LP组上调,87个miRNAs在LP组下调。⑶对112个差异miRNA的靶基因进行预测,得到2444个靶基因。GO富集和KEGG通路分析分别发现425和60个差异的GO条目和KEGG通路。磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B信号通路(PI3K/Akt signaling pathway)、类固醇生物合成通路(Steroid biosynthesis)、细胞凋亡(Apoptosis)、细胞周期(Cell cycle)、有丝分裂原活化蛋白激酶信号通路(MAPK signaling pathway)、环腺苷酸信号通路(cAMP signaling pathway)、河马信号通路(Hippo signaling pathway)和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路(mTOR signaling pathway)能够调节卵泡的生长发育和黄体的形成与退化。⑷miR-214在猪发情周期第7天卵巢中的表达量最低而在第14天表达量最高;在发情周期的第3天和第7天,miR-214在次级卵泡的颗粒细胞中表达水平都大于在优势卵泡颗粒细胞中的表达水平。且在第7天,miR-214的表达量在次级卵泡颗粒细胞中比在优势卵泡颗粒细胞中显著性升高(P<0.05)。⑸通过生物信息学分析我们筛选出miR-214、miR-125b、miR-17-3p、miR-221-5p和miR-149可能是影响猪卵巢黄体期到卵泡期转变的关键候选miRNA。
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