随着中国国家创新体系的逐步实施和完善,各种类型的科研组织在知识创新过程中发挥着越来越重要的作用.因此,科研组织的发展问题也日益成为社会关注的焦点.如何进一步完善运行和管理机制、进一步提高效率和绩效、创造更多的创新成果是科研组织管理面临的重要问题.该文研究的主要目标是,揭示科研组织的运行和演化规律,发展科研组织的管理原则与策略,创新科研组织的管理思想.为了实现上述目标,论文主要进行了如下方面的研究:首先,深入分析了科研组织的内涵及科研组织的复杂性系统特征,论证了应用混沌理论对科研组织进行研究的可行性;其次,提出了科研组织管理熵与管理耗散的基本概念,分析了科研组织管理正熵和管理负熵的影响因素,界定了管理熵值高低与科研组织管理优劣的对应关系,指出了科研组织可以通过管理耗散降低管理熵值,进而为实现管理的混沌状态奠定基础;第三,明确了基于混沌理论的科研组织系统运行的分析框架,选取了较为合理的管理参量,建立了科研组织系统运行的混沌动力学模型,并从理论上对其性质进行了探讨;第四,对科研组织系统的混沌动力学模型进行了模拟分析,探讨了各管理参量对科研组织系统运行的影响,并与科研组织实际运行状况进行了对比分析;最后,结合模型的模拟结果,对科研组织管理的策略选择问题进行了探讨,从新的视角给出了科研组织管理的原则,指出科研组织应通过提高组织的情商和完善对外部环境的响应机制来把握动荡多变的环境,迎接机遇和挑战.从对现有文献资料的调研和对科研院所的实际了解来看,有关科研组织管理的理论和实践研究,大多侧重于传统的管理理论与研究方法.该文以混沌理论为基础,综合应用其他理论和方法,探讨了科研组织发展过程中的影响因素和管理问题,实现了研究方法的创新,填补了国内相关研究的空白.