疟疾是由疟原虫(Plasmodium)引发的一种传染病，对人类危害极大。恶性疟原虫(P.falciparum)全基因组测序已于2002年完成，这为深入研究疟疾的发病机制奠定了分子基础。恶性疟原虫在人体红细胞内期的基因表达研究表明，疟疾发病过程涉及相当复杂的调控网络，需要精准调控胞内各种基因的表达开关与表达水平。人类(Homosapiens)、线虫(Caenorhabditiselegans)、酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)等物种中的实验研究表明，内含子中的顺式作用元件与蛋白质间的相互作用和拼接体与其它表达调控蛋白间的相互作用是调节mRNA稳定性和表达量的两种重要方式。但是在恶性疟原虫基因组中，这些基因序列特征对表达调控的影响研究较少。本文利用生物信息学手段，在全基因组水平上对恶性疟原虫无性红细胞内期的环形体、滋养体、裂殖体3个明显的形态阶段的基因组进行分析，以评估mRNA长度、内含子有无、内含子长度、内含子数目等基因结构特征对mRNA稳定性和表达量的影响。我们发现在恶性疟原虫整个无性红细胞内期的生命周期中，有内含子基因的mRNA更稳定，表达量更高；并且内含子越长，mRNA越稳定，表达最越高：而内含子个数与mRNA稳定性和表达量之间并没有明显的相关性。我们还发现mRNA越长，mRNA越不稳定，表达量也越低。此外，恶性疟原虫mRNA半衰期的变化有一定的规律，即随着红细胞内期发育的进行而逐渐延长。我们进一步分析了红细胞内期中3个阶段特异性表达基因的结构特征与mRNA稳定性和表达量的关系，这与对全部基因的分析结果是一致的。此研究进一步证实了内含子可以提高mRNA稳定性和表达晕。