国家重点实验室作为基础研究和应用研究的双重载体,是国家科研基地乃至科技创新体系不可分割的重要组成部分,在解决重大科技难题、提高我国科技创新水平上发挥了重大作用。国家重点实验室的绩效评价工作,不仅有助于实验室的长期稳定发展,也是国家了解实验室发展状况的重要途径。本文从系统的角度出发,在大量文献积累和科学理论基础上,通过对现阶段国家重点实验室发展状况和评估规则的分析,发现其中存在的问题。基于平衡计分卡的客户、财务、内部流程、学习与成长四个维度和现有评价指标的总结,搭建了一套符合国家重点实验室战略发展的投入-产出绩效评价指标体系。利用层次分析法、熵权法和数据包络分析法建立了基于熵权-AHP的DEA评价模型。在此基础上,本文选取了某领域的9个国家重点实验室,运用数据包络分析法(DEA)计算了国家重点实验室二级指标的相对效率值,并通过层次分析法(AHP)和熵权法分别计算得到平衡计分卡四个层面的主观权重和客观权重,最终得到了各个实验室的综合绩效评价结果,并针对性地对未来国家重点实验室的发展提出了相关的建议。