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目的 了解原发性肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)合并乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染者的HBV基因特征状况及其与肝癌的关系。方法2012-2015年在我国青海海南藏族自治州、广西隆安县、河北正定县、上海黄浦区、河南开封市和湖南湘潭市建立HCC监测网络,收集HCC合并HBV感染者作为肝癌组,同时从2012-2015年肝炎室全国乙肝监测样本库中选择相同地区的未患HCC和肝硬化(Liver cirrhosis,LC)的慢性乙型肝炎患者作为对照组。采用酶联免疫吸附试验(Enzyme-linked immunosorbent assay,Elisa)检测样本的HBV感染指标。利用QIAGEN公司的QIAamp DNA Blood Mini Kit试剂盒提取HBV脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA)并用巢氏聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)法扩增 HBV 基因序列。双向测序后用 DNAstar(SeqMan)软件进行序列拼接。并利用MEGA6软件与从GeneBank中获取的49株标准参照株序列进行序列比对以确定基因型。用Bioedit软件分析样本序列的 C1653T、T1753V、A1762T/G1764A 双突变、G1896A 和 PreS 缺失突变等位点的突变情况,并将PreS区核苷酸序列采用标准密码子翻译成氨基酸,观察其序列情况。利用SPSS16.0软件进行统计分析。结果肝癌组共采集到血清546份,其中HBsAg阳性有334例,阳性率为61.2%。对照组则在每个地区采集25例,共150例,HBsAg均为阳性。肝癌组中86例样本和对照组中39例样本成功扩增到目的基因序列HBV S区和基本核心启动子区(Basal core promoter,BCP)/Precore区。其中,肝癌组≥50岁占比高于对照组中≥50岁占比,组间差异有统计学意义(80.23%[69/86]比33.34%[13/39],χ2=26.153,P=0.000,OR=8.118;95%CI=3.465-19.019)。肝癌组中基因型C占比高于对照组中基因型C占比,组间差异有统计学意义(81.40%[70/86]比58.97%[23/39],χ2=9.961,P=0.002,OR=4.261,95%CI=1.667-10.889)。未发现性别、HBeAg 阳性率组间差异有统计学意义。肝癌组患者较对照组患者HBV前S缺失突变发病率高,差异有统计学意义。(34/86[39.53%]比 8/39[20.51%];χ2=4.350,P=0.037,OR=2.534;95%CI=1.041-6.166),进一步分析发现,只有PreS2缺失突变与HCC的发生是有统计学意义。(χ2=4.747,P=0.029,OR=3.506;95%CI=1.084-11.340)。HBVPreS1和PreS2起始密码子缺失在与肝癌组和对照组中都存在。PreS缺失突变多发生在人血清白蛋白受体(88.10%[37/42])和S启动子(38.10%[16/42])、但较少发生在肝细胞结合位点(11.90%[5/42])和 CCAAT盒(9.52%[4/42])。肝癌组的A1762T突变率、A1762T/G1764A双突变率分别为74.42%和72.09%,均高于对照组的53.85%和53.85%,差异有统计学意义,未发现两组间G1764A、G1896A、T1753V突变的差异具有统计学意义。≥50岁年龄组的A1762T、A1762T/G1764A的突变率显著高于<50岁年龄组;基因型C的A1762T、G1764A、A1762T/G1764A的突变率显著高于基因型B,而基因型B的G1896A突变率显著高于基因型C。年龄≥50 岁[Adjusted odds ratio(AOR)=9.349,95%CI=3.329-26.257,P值=0.000]、基因型 C(AOR=28.875,95%CI=4.897-170.258,P值=0.000)和G1896A(AOR=7.648,95%CI=1.564-37.4,P值=0.012)是肝癌的独立危险因素。年龄≥50岁肝癌危险性是年龄<50岁的9.349倍,基因型C肝癌危险性是基因型B的28.875倍,G1896A患肝癌危险性是非突变者的7.648倍,而尚不能认为性别、HBeAg、PreS 缺失突变、A1762T、G1764A、T1753V、A1762T/G1764A 是肝癌的独立危险因素。结论肝癌组患者中>50岁占比和基因型C占比均高于对照组;肝癌组患者的PreS缺失突变、A1762T突变和A1762T/G1764A双突变率均高于对照组;高年龄组和感染基因型C的人群发生A1762T、A1762T/G1764A的可能性更高;年龄≥50岁、基因型C、G1896A是肝癌的独立的危险因素,有更高的发生HCC风险。