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新疆野生核桃(Juglans regia L.)是我国栽培核桃的直系祖先,全世界大面积集中分布的野核桃林只有两处,新疆巩留县的野核桃林是其一。新疆野生核桃林是我国非常珍稀的野生植物资源,但是国内现在对这一宝贵资源的研究很少。本研究利用SRAP标记来进行新疆野生核桃遗传多样性的研究和核心种质的构建,通过对遗传参数的分析来了解野核桃的亲缘关系,为利用新疆野生核桃种质资源进行育种、遗传图谱构建等提供了分子依据,为新疆野生核桃这一珍贵资源科学有效地保存、评价与鉴定提供了科学依据。1.建立了新疆野生核桃SRAP的反应体系,最终筛选出15对SRAP引物,在20μL的SRAP反应体系中,DNA为50ng、引物为0.4μmol/L、Mg2+为2mmol/L、dNTPs为0.2 mmol/L、Taq酶0.5U;剩余体积用双蒸水补齐。应用该15对引物组合对新疆野生核桃叶片DNA进行扩增反应,结果显示被扩增的DNA多态性丰富、有很好的重复性。2.对新疆野生核桃的种质资源和遗传多样性进行了分析研究,15对不同引物组合位点的Nei’s多样性指数平均值为0.3868;shannon’s多样性指数平均值为0.5720,群体的多态位点百分率为94.07%,说明各位点的多态性很丰富。基因分化系数(Gst)的平均值为0.1152,说明新疆野生核桃群体存在中等分化;区域内的遗传多样性占新疆野生核桃总遗传多样性的86.61%,说明新疆野生核桃总的变异主要存在于不同区域的内部。3.由Nei’s得出的数据对不同区域进行聚类分析,结果显示:遗传距离一定时,野核桃可归为两大类,且归类的居群地域很相似。4.选择48个样本组成新疆野生核桃的核心种质,取样比例是原始种质的1.14%。t测验的结果表明,在0.05水准下,试验所取核心种质与原始种质无明显差异,且核心种质的Ne、Nei’s和shannon’s指数的保留率分别为100.01%、100.02%、100.02%,说明本研究构建的野核桃核心种质能够很好地代表原始种质的多态性。构建的48份核心种质包含了新疆野生核桃原始种质的树皮光滑程度、树高、枝条色泽、病(虫)害、果形、开花次序等变异。