华山新麦草三个SnRK2基因的克隆及表达分析

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:w_wallace
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
植物在长期进化过程中受到包括干旱、盐渍、重金属毒害等在内的多种非生物胁迫,严重限制作物生物产量及生物质产量的提升。多种蛋白激酶及蛋白磷酸酶参与到植物对压力信号的识别和转导中,其中蔗糖非发酵相关蛋白激酶家族成员SnRK2在植物生长和新陈代谢相关的逆境信号应答调控方面发挥重要作用。尽管目前已有关于SnRK2在拟南芥、水稻、玉米、小麦等多个物种的相关研究,然而对其在逆境应答响应中作用的分子机制及功能表达涉及较少,且尚无SnRK2在小麦近缘野生属物种—华山新麦草上的相关报道。华山新麦草(Psathyrostachys huashanica Keng ex P. C. Kuo)是仅生长于我国陕西华山的一类禾本科(Poaceae)小麦族(Triticeae)新麦草属(Psathyrostachys Nevski)多年生草本植物,具有早熟、优质、抗病、抗旱、耐盐碱等多项优良特性。本研究根据矮秆波兰小麦相关转录组数据,设计8对特异性引物来克隆华山新麦草中SnRK2基因全长cDNA序列,得到其中的3个,即PhSnRK2.5、PhSnRK2.8和PhSnRK2.11。通过生物信息学分析及逆境胁迫处理条件下的表达模式分析,揭示华山新麦草中3个SnRK2基因家族成员的表达特性。研究结果如下:1.华山新麦草PhSnRK2.5全长cDNA序列为1252 bp,包含870 bp的开放阅读框、148 bp的5’-UTR和234 bp的3’-UTR。与矮秆波兰小麦同源序列TpSnRK2.5相似,PhSnRK2.5提前出现终止密码子仅编码了290个氨基酸。PhSnRK2.5与小麦、玉米、水稻和拟南芥同源基因的相似度分别为99.6%、92.5%、91.4%和82.0%。该蛋白激酶具有高保守N端结构域和不完整的C端,包含一个ATP结合位点、一个N端豆蔻酰胺化位点、一个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶激活位点、一个潜在的跨膜域和一个激活环。2. PhSnRK2.8全长cDNA序列为1473 bp,包含1251 bp的开放阅读框、44 bp的5’-UTR和44 bp的3’-UTR,编码367个氨基酸。与小麦、玉米和水稻相关同源基因的相似度分别为90.4%、94.8%和96.4%。PhSnRK2.8具有高保守N端催化域和酸性C端调控域,存在一个ATP结合位点、一个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶激活位点及一些典型SnRK2基序特征结构如N端豆蔻酰胺化位点、跨膜结构域、激活环等。3. PhSnRK2.11全长cDNA序列具有1164 bp,包括1080 bp的开放阅读框和84 bp的3’-UTR,编码360个氨基酸,与玉米ZmSnRK2.11的相似度仅为83.1%。N端结构域存在一个ATP结合位点、一个N端豆蔻酰胺化位点、一个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶激活位点、一个潜在跨膜结构域和一个激活环。4.PhSnRK2.5和PhSnRK2.11均属于第一亚族,不受ABA激活;而PhSnRK2.8归属于第三亚族,为ABA依赖蛋白激酶类群。5.表达定量分析结果表明PhSnRK2.8和PhSnRK2.11能够响应ABA、重金属、高盐和高渗的胁迫诱导并且不同处理条件下的表达模式存在明显差异。根据表达峰值出现时间的先后,PhSnRK2.8对这四种胁迫诱导处理的敏感程度为:重金属>高盐>ABA>高渗,而PhSnRK2.11的表达敏感程度:高渗>高盐>ABA>重金属。
其他文献
随着网络对教育产生的巨大影响,网络环境下的学习方式也越来越成为人们关注的话题。文章论述了网络环境下学生自主学习方式的意义与理论依据,充分发挥学生学习的自主能动性,让学
自从《长江7号》片名和故事梗概公布以来,上至媒体下至普通影迷就在纷纷猜测这是片中外星飞碟的名称。但周星驰及中影集团此前从未对此观点进行证实。随着20D7年11月下旬《长
氯氮平是一疗效很好,并在临床上广泛应用的非经典抗精神病药物,许多临床医生将氯氮平作为一线治疗药物,但如应用不慎,其副作用相当多见,有的甚至危及生命,护士应在用氯氮平的治疗过
如果银幕是时代的捕手,时尚则是时代的调色板。在波普艺术、摇滚风盛行的60年代,简·方达穿着黑色紧身的皮装和性感长靴在《Barbarella》中脱颖而出,成为引领时尚的风向
期刊
说到底,他只是一个故作邪恶的居家好男人。虽然当年胆小的少年最终成为恐怖片导演这件事令人匪夷所思,不过北野武《小奏鸣曲》中"因为怕死所以才会开枪"的台词,或许正好为冢
本文基于商品流通企业原有的ERP系统,综合应用目前先进的数据仓库技术、OLAP技术、数据挖掘技术、HTML5网页设计技术和企业管理理论及模型,构建一个适用于商品流通企业的决策
目的观察鼠神经生长因子联合注射用血塞通治疗急性脑梗死的效果及对神经功能缺损、生活质量的影响。方法2015年8月至2017年12月该院诊断的急性脑梗患者140例,随机分为观察组
近年来的计划生育服务站(生殖保健院),虽然在计划生育工作中发挥了很大作用,受到了广大基层干部、群众的欢迎和支持,但在管理上尚有不足。要合理组织计划生育技术工作和进行科学
为了得到能更好应用于CAD系统的细分曲面造型方法,提出一种基于B-样条的对称非均匀细分算法,其中的思想和均匀Lane-Riesenfeld节点插入算法相似。基于B-样条的节点插入算法,以Blossoming为工具,计算出细分后的新控制顶点。细分后得到的极限曲面由张量积样条曲面组成,在奇异点达到2C连续。与传统的细分曲面算法相比,该细分曲面算法具有良好的局部支撑性,大大降低了算法的复杂度,而且该算法