在市场经济不断发展、竞争愈演愈烈的今天，企业并购已发展成为一种不可阻挡的世界潮流。目标企业的价值评估作为并购中的核心环节，选用评估方法又是关键，因此，研究企业并购中目标企业的价值评估，对丰富企业价值评估体系，提高评估结果的准确性，以及我国并购市场和资本市场的健康快速发展具有一定的现实意义。本文采用理论加实证分析的方法来研究企业并购中目标企业的价值评估，在借鉴国内外企业价值评估方法的理论和经验的基础上，对企业并购和企业价值评估的基本理论作了简要阐述，并分析了影响并购中目标企业价值评估的因素以及并购中目标企业价值评估的意义。在此基础上，探讨了企业价值评估中最主要的三种方法：资产基础法（成本法）、市场法和收益法，比较分析出每种方法的应用前提、优缺点和适用范围，并介绍了目前并购市场中企业价值评估方法的使用现状，综上得出本文选用的方法为：以资产基础法（成本法）为基础，运用收益法中的企业自由现金流模型进行验证。在基于价值评估的实证分析部分，以M公司并购H公司这一真实的评估项目为例，结合H公司的行业环境、经营情况和财务数据，运用资产基础法（成本法）对H公司的各项资产进行评估，再运用收益法中的企业自由现金流模型进行整体评估，并对两种评估结果进行分析，最终选用收益法的评估结果为H公司的评估价值。最后归纳总结了实证分析中存在的不足，提出了对企业价值评估方法的展望，并对企业并购中目标企业价值评估提出了一些建议。