随着经济全球化程度加深,国内外技术创新研究理论不断涌入,企业充分意识到研发创新才能让企业能立足于激烈的市场竞争中。众所周知,研发创新虽然能促进产业发展,提升综合实力,但由于外部性、风险高等因素的存在,企业在创新活动中所获得的边际收益低于社会边际收益,必然影响企业研发投入的积极性。人口老龄化、人民健康意识增强等多因素叠加都使得医药需求持续增长,医药制造业因此被称为“永不衰落的朝阳产业”,医药制造业拥有广阔的市场前景和潜力,但同时也面临着创新方面的挑战。政府调控经济的政策手段多样,均会对企业研发创新产生一定的影响。我国政府在财政补贴和税收优惠政策方面都对医药制造业有一定的倾斜,力求促进我国医药制造业企业竞争力增强,目前学术界研究两种政策对医药制造业企业影响效应的文献较少,本文基于此,从理论和实证两方面深入研究财政补贴和税收优惠对医药制造业企业研发投入的影响,具有理论和现实意义。在理论研究中,本文首先将国内外相关文献按照学者的研究观点进行了分类梳理,并从理论的角度介绍了财政补贴、税收优惠对医药制造业企业研发投入的影响机制,分析了医药制造业整体研发投入现状及财政补贴、税收优惠政策实施情况。同时,为了增强我国医药制造业创新能力,本文接着介绍了医药制造强国——美国及部分欧盟国家的财政补贴和税收优惠政策。在实证过程中,本文通过数据剔除和运用Stata进行数据处理,筛选出医药制造业121家A股上市公司作为研究样本,从Wind数据库和年报中获取2014年至2019年的变量指标,构建财政补贴和税收优惠政策对医药制造业企业研发投入的多元回归模型,分析了二者对医药制造业上市公司研发投入的影响效果,并比较二者对医药制造业上市公司研发投入的影响效果的差异性。通过对本文面板数据进行多元线性回归,验证得出以下结论:（1）财政补贴和税收优惠对医药制造业企业研发投入均有促进作用。（2）不同性质、不同规模、处于不同成长阶段、不同负债水平和盈利水平的企业的研发投入强度有所不同。（3）相比于税收优惠,财政补贴对医药制造业企业的促进效果更显著。最后,研发投入强度是衡量企业研发创新的重要指标。依据理论分析中提到的不足和实证结果,本文从政府角度和企业角度提出相应的政策建议。建议政府提高税收优惠立法层级,完善直接税优惠政策并增强间接税优惠政策,继续加大财政补贴力度,同时灵活管控财政资金审批,加大对中小企业扶持力度,并进一步优化财政补贴和税收优惠政策搭配。同时,建议企业充分有效利用财税优惠政策,加强产学研合作。