lncRNA rp11-521C20.3-BMF信号通路在GOPD肺泡上皮细胞凋亡作用机制研究

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:abczvw
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目 的]慢性阻塞性肺疾病(Chronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD)的发生发展除了受多种环境影响外,更多的是受到遗传因素影响,本研究利用基因芯片对COPD患者外周血lncRNA及mRNA表达谱进行检测,构建COPD患者的lncRNA及mRNA差异表达谱。通过生物信息学技术,预测差异表达的lncRNA及其靶基因的生物学功能,同时应用RT-qPCR验证筛选出的lncRNA及其靶mRNA表达水平,探讨COPD发病过程中可能涉及的分子机制。[方法]我们选择了 2017年1月在昆明医科大学第一附属医院呼吸科收住院的3例吸烟的COPD患者作为实验组,对照组选择肺功能检测正常的3例健康吸烟志愿者。收集所有受试者的清晨空腹静脉血。通过人微阵列技术检测了有吸烟史的COPD患者(n=3)健康对照组(n=3)血液中lncRNAs和mRNAs的差异表达。然后利用基因本体论(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)途径,对差异表达的lncRNAs和mRNAs进行分析,以发现差异表达的基因可能参与的生物学通路。接着,我们收集了 2017年1月至12月在昆明医科大学第一附属医院呼吸科住院的有吸烟史的COPD患者以及体检肺功能正常的吸烟健康者各50例清晨空腹血液标本,利用RT-qPCR法进一步验证前期芯片中lncRNA及mRNA的表达水平。而后收集了吸烟COPD合并肺癌的远癌组织,及未患COPD的气胸肺组织各 5 例,进一步在组织水平对 lncRNA rp11-521C20.3 和 BMF(Bcl-2 modifying factor)的表达情况进行验证。[结果]通过微阵列技术,发现COPD患者及健康吸烟者外周血中存在大量表达差异的lncRNA和mRNA,两组共有3359个lncRNAs表达差异,其中1995个lncRNAs在copd中表达上调,1364个lncRNAs表达下调;mRNA芯片检测结果提示共有175个mRNA在COPD组与对照组之间的表达差异具有统计学意义,其中上调的有147种,下调的有28种。通过生物信息学分析提示表达差异的mRNA主要参与COPD的多种生物学过程,主要包括炎症、代谢等。差异倍数较大且可能与COPD发生、发展相关的mRNA有7种,包括:BMF、TRIM13、PDE4B、MYL-9、PFKFB3、ARIH2、CLEC2B 等,在 lncRNA-mRNA 位置对应表中进行搜索,最终仅获得与BMF基因位置上有反义关系的lncRNA rp11-521C20.3,可能在BMF的基因转录和翻译上有重要作用。通过50例人外周血进行qRT-PCR验证后显示,RP11-521C20.3在吸烟COPD组中相对表达量(COPD组2^-△CT=0.357)低于吸烟健康对照组的相对表达量(对照组2^-△CT=1),即RP11-521C20.3在COPD组中表达下调。BMF在吸烟COPD组中相对表达量(COPD组2^-△CT=1.924)高于对照组的相对表达量(对照组2^-△CT=1),即mRNA在COPD组中表达上调。故lncR-RP11-521C20.3、BMF的相对表达水平在病例组与对照组之间差异有统计学意义(P<0.05)。采用qRT-PCR验证两组患者肺组织中lncR-RP11-521C20.3和BMF的表达量,结果显示COPD组BMF在肺组织中的mRNA表达量高于对照组,而与其有位置关系的lncRNA RP11-521C20.3下调,并且两组的BMF和lncR-RP11-521C20.3表达量差异有统计学意义(P<0.05)。进一步验证了前期基因芯片结果。[结 论]微阵列基因芯片分析表明,有吸烟史的COPD患者与健康吸烟者相比,外周血中存在差异表达的lncRNA与mRNA。其中lncR-RP11-521C 20.3表达降低,与其位置邻近的促凋亡基因BMF表达增高。通过生物信息学方法预测lncR-RP11-521C20.3的靶基因可能是与凋亡密切相关的BMF,进而对COPD患者血及肺组织采用QPCR验证lncR-RP11-521C20.3和BMF的表达量,证实了前期结果,提示lncR-RP11-521C20.3可能在COPD的凋亡中起重要作用,为COPD的防治提供新证据。
其他文献
金桂飘香时,正是孕育桃李季。10月22日,顾景舟紫砂艺术学院成立一周年庆典暨揭牌仪式在江苏省陶都中等专业学校举行。宜兴市人民政府周斌副市长、宜兴市人大赵菊明副主任、宜
人格与财产的二元划分作为近来以来民法体系的重要基石,不论是在民法的历史溯源、哲学基础,还是体系编排、立法技术,抑或司法适用、制度修订上都有着根本性的影响,而“财产上
本文主要对电力电子变压器的特点与优势及在输电系统中的控制策略进行研究,同时也使得电网向着智能化的方向发展。但传统的配电变压器不能很好的满足智能电网的要求,在这一背
近年来,随着越来越多的信息通讯技术用于社区建设和社区管理,我们的社区管理和社区服务提供变得越来越智能,出现了智慧社区的概念。智慧社区通过使用各种信息技术和基础设施,
数据显示,2015年全国共演出儿童剧1.87万场,票房总收入近9个亿;年轻的父母们显然开始更注重孩子的体验,儿童剧市场进入发展“快车道“。
本研究以两年生菲白竹(Sasa fortunei)、菲黄竹(Sasa auricoma)、黄条金刚竹(Pleioblastus kongosanensis)、美丽箬竹(Indocalamus decorus)和白缟椎谷笹(Sasaella glabra)等
目的探讨脾虚证与骨骼肌收缩功能的关系。方法将36只ICR小鼠按体重配对原则随机分成3组,即对照组、劳倦过度组及大黄组,每组12只。其中劳倦过度组及大黄组应用大黄泻下法和力
<正>酒,和一个打虎的英雄有关,三碗酒,就让那些光阴汇聚,一口传奇的酒,便温暖了一个有关酒的话题。酒是沿着历史走来的,它的妩媚需要光阴的沉淀,冉冉升起的香气,与那些远去的
期刊
齿轮齿条钻机作为一种新型钻机,将齿轮齿条结构与顶驱集成装置替换传统钻机起升系统以及旋转系统,具有传动效率高、结构紧凑、在浅层钻进时能够主动施加钻压的优点。齿轮齿条作为齿轮齿条钻机的关键构件之一,通过多个齿轮与安装在井架上的齿条啮合,驱动提升箱的上下运动。齿轮齿条在长期交变载荷作用后容易发生齿根弯曲疲劳断裂或者齿面疲劳磨损。因此提高齿轮齿条的疲劳寿命也是齿轮齿条钻机的重要设计内容,目前我国关于齿轮齿
目的:评估经上皮准分子激光角膜切削术(TransPRK)和准分子激光上皮瓣下角膜磨镶术(LASEK)两种方法治疗中低度近视的疗效。方法:连续收集我院行表面切削手术的80例患者,分为TransPRK