胃癌中microRNA-375基因高甲基化及表达的研究

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目的:胃癌是人类常见的恶性肿瘤之一,占我国目前恶性肿瘤死亡的第一位。其早期症状不明显并且缺乏有效的治疗措施,因此寻找新的诊断和治疗靶点对胃癌的早期诊断、治疗以及预后具有重要的临床意义。DNA甲基化是调控基因表达的一种重要的表观遗传学过程,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育及人类肿瘤发生中起着重要作用。肿瘤细胞中DNA甲基化异常概括为基因组整体低甲基化和抑癌基因调控区域高甲基化。MicroRNA (miRNA)是真核生物中一类长度约18-25个碱基的小分子非编码RNA,肿瘤细胞中miRNA的表达受到包括DNA甲基化修饰在内的多种机制的调控,其异常表达与肿瘤的发生、发展及演进有着极为密切的关系。以往的研究表明miRNA-375在胃癌、食管癌等多种肿瘤中低表达,本研究应用生物信息学方法预测其基因启动子区存在CpG岛,通过检测胃癌组织中miRNA-375基因甲基化水平及基因表达水平,探讨其启动子区CpG岛甲基化改变是否参与胃癌组织中miRNA-375异常表达的调控,并进一步预测胃癌中]miRNA-375可能调控的靶基因,为将miRNA基因甲基化作为胃癌早期诊断及治疗的靶点提供依据。方法:1经内镜及手术取90例新鲜组织活检标本,分为两组:胃癌组54例,正常对照组36例。2应用生物信息学进行miRNA-375基因启动子区CpG岛预测并设计甲基化特异性PCR(MSP)引物。提取基因组DNA,应用MSP检测组织1miRNA-375基因启动子区CpG岛甲基化。3提取总RNA,应用实时荧光定量反转录PCR(real-time qRT-PCR)检测组织miRNA-375基因表达。4运用TargetScan Human等生物信息学方法,预测niRNA-375可能的靶基因。结果:1miRNA-375基因甲基化1.1胃癌组织中:miRNA-375基因甲基化胃癌组和正常对照组miRNA-375基因甲基化阳性率分别为62.96%(34/54)和22.22%(8/36),两组相比,差异有统计学意义(P<0.05)。1.2miRNA-375基因甲基化与胃癌临床病理学特征的关系高中分化组与低分化组miRNA-375基因甲基化阳性率分别为44.44%(8/18)和72.22%(26/36),两组相比,差异有统计学意义(P<0.05)。miRNA-375基因甲基化阳性率与患者性别、年龄、淋巴结转移及临床病理分期(TNM分期)的差异均无统计学意义(P>0.05)。2miRNA-375基因表达2.1胃癌组织中miRNA-375基因的表达胃癌组miRNA-375基因的表达低于正常对照组,是其表达水平的0.148倍,两组相比,差异有统计学意义(P<0.05)。2.2]miRNA-375基因表达与胃癌临床病理学特征的关系高中分化组miRNA-375基因表达高于低分化组,是其表达水平的3.046倍,两者相比,差异有统计学意义(P<0.05)miRNA-375基因表达水平与患者性别、年龄、淋巴结转移及临床病理分期(TNM分期)无明显关系,差异均无统计学意义(P>0.05)。3生物信息学分析示SP1、AHR、GATA6、KLF4等可能为miRNA-375的靶基因。结论:1预测]miRNA-375基因启动子区存在CpG岛,并证实胃癌组织中存在miRNA-375基因启动子区CpG岛高甲基化,miRNA-375基因高甲基化与胃癌组织分化程度相关。提示miRNA-375基因启动子区甲基化水平检测有助于胃癌早期诊断及预后的判断。2胃癌组织中存在miRNA-375基因异常低表达,且与组织分化程度相关。miRNA-375基因高甲基化可能抑制miRNA-375基因表达,在胃癌发生发展中发挥重要作用。3miRNA-375可能通过调控SP1、AHR、GATA6和KLF4等靶基因的表达参与胃癌的发生发展,为进一步研究胃癌中niRNA-375的作用机制提供依据。
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