西藏是一个特殊的地区，特殊性决定了西藏发展目标、发展途径的特殊性，科学地选择和制定产业发展战略，是西藏提高自身发展能力的关键所在。西藏藏药制造业作为西藏特色产业之一藏医藏药的核心组成部分，既是西藏为数不多的高新技术企业主体组成，又是藏医藏药技术创新最为活跃的主体。发挥好税收政策职能，促进西藏藏药制造企业的技术创新，实现藏药制造业又好又快的发展，不仅是符合西藏实际及其资源禀赋特征的选择，也是符合社会发育程度和经济发展水平的选择，而且对增进民族团结、发展民族经济、实现富国强民具有积极的意义。　　本文是在充分掌握资料和实践调查的基础之上，理论与实践相结合，采用实证分析与规范分析相结合，定性分析为主与定量分析为辅等方法，以税收促进企业技术创新为基本理论依据，以“西藏藏药制造业技术创新现状”、“促进西藏藏药制造业技术创新的税收政策概述”、“促进藏药制造业技术创新的税收政策分析”、“完善健全促进藏药制造业技术创新的税收政策”为本文的基本框架进行综合的论述。　　首先，通过对西藏藏药制造业技术创新现状及问题进行分析，认为西藏藏药制造业存在技术研究开发投入不足，产品科技水平低，缺乏自主知识产权保护，企业重复建设效率低下，藏药材资源匮乏等问题;论证了推进藏药制造业技术创新的必要性。其次，通过结构分析和对比分析方法，就西藏独特的税制与全国税制进行了简单的比较，简述了中央赋予西藏特殊的财税政策，总结认为西藏税制相比全国税制具有“税制简、税负轻、优惠大”的特点，并按税种分类列举了涉及促进藏药制造业技术创新的税收政策，为后文分析作了必要的铺垫。然后在总结分析藏药制造业税收现状的基础之上，指出了目前促进藏药制造业技术创新的税收政策存在的基本问题:即税收优惠手段单调简单，优惠对象不科学;藏药制造业增值税税负偏高，行业性增值税优惠政策并没有涵盖藏药制造业;促进技术创新的税收优惠政策没有统一的行业标准，政出多门，相互重叠，此消彼长;在开发和保护藏药材上缺乏税收激励和保护措施;个人所得税对藏药制造业技术人员没有实质激励效应;缺乏对风险投资的税收优惠等6个方面。最后从完善和提高的角度，就如何合理调整资源配置，发挥税收政策导向和宏观调控作用，更好地促进藏药制造业技术创新，实现其又好又快的发展提出具体的税收政策建议。　　为此，本文提出首先从长远的角度要灵活运用中央赋予西藏适当变通的税政管理权，通过制定适合西藏藏药制造业技术创新的税收政策，建立方式多样的税收优惠结构，明确优惠对象，推行税式支出管理。其次根据西藏实际在藏药制造业中率先推行增值税改革试点，从增值税税率的设置，进项税额的抵扣，消费型增值税实施等角度提出了在藏药制造业中推行增值税改革的方向;最后是针对目前税收政策中激励技术创新存在的空白，提出了建立鼓励风险投资的税收制度，完善个人所得税政策，明确对从事藏药制造业高科技开发科技人员税收鼓励措施，出台鼓励藏药企业通过兼并合并做大做强的税收政策，建立完善有利于藏药材资源保护和开发并重促进生态文明的税收政策，推进西藏藏药制造业技术创新，实现西藏藏药制造业的可持续发展。