自从意识到细胞是生命体最基本的单位起,研究人员就一直试图根据细胞特征对细胞类型进行表征和分类,然而传统群体水平上的RNA-seq与基因芯片的分析忽略了组织细胞间的异质性,这样便很在单细胞的水平上反应生命的活动规律。因此,要想更加深入地了解和分析组织中细胞基因的表达情况,只有从单细胞的层面入手,才能发现和研究细胞间的异质性,表达差异,甚至鉴定出新的细胞类型。基于此,有关于单细胞方面的技术开始出现。本文介绍了由我们实验室自主研发的单细胞测序分析平台—Microwell-seq,相对于其他单细胞测序分析平台而言,Microwell-seq具有成本低、高通量、易操作等特点,大大降低了单细胞测序分析的成本,推动了单细胞测序技术的发展。在本文中,介绍了 Microwell-seq的操作流程以及后续数据的分析,同时使用该平台对小鼠的胰腺和肝脏进行了实验以及后续的数据分析,不仅对小鼠的胰腺与肝脏细胞做了分类,同时也证明了 Microwell-seq 平台的广泛适用性。