长链非编码RNA uc002bbp.2在非小细胞性肺癌顺铂耐药中的机制研究

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研究背景:肺癌细胞对化疗药物的耐药性常制约着疗效的发挥,是导致晚期非小细胞性肺癌(NSCLC)患者化疗失败的主要因素之一。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)是非编码RNA的重要类型,已被证实可以通过多种机制调节肺癌细胞对化疗的敏感性。研究目的:明确lnc RNA uc002bbp.2与NSCLC对顺铂耐药的关系并初步阐释lnc RNA uc002bbp.2在NSCLC顺铂耐药过程中的生物学功能。研究方法:(1)检测细胞株对顺铂的耐药性:通过MTT法检测NSCLC细胞株A549及其顺铂获得性耐药株A549/DDP在不同浓度顺铂培养下,不同培养时间点对顺铂的半数抑制浓度(Half maximal inhibitory concentration,IC50),明确A549/DDP细胞株对顺铂的耐药性并确定后续实验的时间点;(2)对A549及A549/DDP细胞行基因芯片lnc RNA高通量测序分析lnc RNA的表达差异。并选取差异倍数大的一条lnc RNA进行深入研究(本研究中选取lnc RNA uc002bbp.2)。(3)通过q RT-PCR法检测A549及A549/DDP细胞中lnc RNA uc002bbp.2的表达水平;同时检测标准一线含铂化疗方案治疗后评估为部分缓解和疾病进展的NSCLC患者的确诊肿瘤组织lnc RNA uc002bbp.2的表达水平,并对比不同疗效患者(疗效分别为部分缓解和疾病进展)表达水平的差异;(4)探究lnc RNA uc002bbp.2表达水平与NSCLC细胞顺铂获得性耐药性之间的关系:构建lnc RNA uc002bbp.2的过表达质粒和干扰质粒,上调A549细胞中lnc RNA uc002bbp.2的表达水平并下调A549/DDP细胞中lnc RNA uc002bbp.2的表达水平后,通过MTT法检测调控表达后的细胞对顺铂的IC50值;(5)lnc RNA uc002bbp.2在细胞中的功能探究:上调A549细胞或下调A549/DDP细胞中lnc RNA uc002bbp.2的表达,予以顺铂处理,MTT法检测细胞存活率及IC50值;流式细胞术检测细胞凋亡水平;q RT-PCR、western blot法检测与NSCLC细胞凋亡、增殖及EMT等生物学行为相关的多种标记物的m RNA或蛋白质的表达水平。研究结果:(1)MTT试验结果提示,顺铂处理细胞各时长(12h,24h,48h),A549/DDP细胞对顺铂的IC50值均大于A549细胞。在24h和48h,两种细胞的IC50值具有显著性差异,且在24h时差异最大。(2)基因芯片lnc RNA高通量测序检测A549及A549/DDP细胞中lnc RNA表达并分析后发现,与A549细胞相比,A549/DDP细胞中有59条lnc RNA表达显著上调,48条lnc RNA表达显著下调(倍数差异在5倍以上),其中lnc RNA uc002bbp.2是表达上调倍数最高的lnc RNA之一。(3)通过q RT-PCR法发现,相比A549细胞,A549/DDP细胞的lnc RNA uc002bbp.2表达水平显著上调。检测含铂化疗方案一线治疗的NSCLC患者肿瘤组织后发现,疾病进展组患者肿瘤组织中的lnc RNA uc002bbp.2表达水平显著高于疾病缓解组患者。(4)上调A549细胞中lnc RNA uc002bbp.2表达水平后,细胞对顺铂的IC50值显著上升;下调A549/DDP细胞中lnc RNA uc002bbp.2表达水平后,细胞对顺铂的IC50值显著下降;平板克隆形成实验结果显示上调A549细胞中lnc RNA uc002bbp.2的表达水平对细胞的增殖无明显影响。(5)上调A549细胞中lnc RNA uc002bbp.2的表达水平对细胞的凋亡水平无明显影响。(6)相比A549细胞,A549/DDP细胞中上皮-间质转化(EMT)相关标记物的m RNA水平有变化(N-cadherin、Twist下调;MMP2、MMP9表达水平上调),而增殖、凋亡相关标记物的m RNA水平无明显变化。Western blot结果提示,上调A549细胞中lnc RNA uc002bbp.2表达水平后,MMP2、MMP9、SNAIL、Vimentin、E-cadherin蛋白表达水平降低,N-cadherin表达水平增高;下调A549/DDP细胞中lnc RNA uc002bbp.2表达水平后,MMP2、MMP9、SNAIL、Vimentin、E-cadherin蛋白表达水平上升,N-cadherin表达水平降低。研究结论:Lnc RNA uc002bbp.2能调控NSCLC细胞对顺铂的敏感性及顺铂耐药过程中EMT表型的形成。Lnc RNA uc002bbp.2不影响NSCLC细胞的增殖及凋亡水平。
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