在世界新科技革命推动下，国民财富的增长和人类生活的改善越来越有赖于知识的积累和创新，自主创新能力，尤其是科技创新能力日益成为国际综合国力竞争的焦点。自主创新有多种模式，由于存在“后发优势”，消化吸收再创新是大多数发展中国家倾向采用的方式，而在经济全球化的背景下，外商直接投资的流入无疑是发展中国家获得所要消化吸收的先进技术或知识的重要途径。因此，外商直接投资与东道国自主创新能力的形成之间必然存在某种联系，这种联系的重要纽带就是具有不确定性的FDI的“溢出效应”和自主创新能力形成的内生控制变量。不同来源地、不同进入方式的外商直接投资对不同国家(地区)、不同产业的自主创新能力形成的作用往往有所不同，因此，有关外商直接投资对东道国自主创新的作用还存在很大争议。但可以确定的是，当FDI的“溢出效应”为正，东道国吸收能力较强，并且自主创新的内生条件和外部环境相对成熟时，外商直接投资对东道国自主创新能力的影响是积极的。这一结论通过对我国东、中、西部自主创新能力和外商直接投资关系的实证研究也得到了验证。自主创新能力的形成有其客观规律，结合我国的国情和科学技术发展的实际，在现阶段，充分利用外资的外延式自主创新应是我国增强自主创新能力的首选方式。因此，我国应从二者作用机制的各个环节入手，相机调整，在立足本国力量的基础上充分发挥外商直接投资的积极作用，提升我国的自主创新能力。