QSAR及其在新型农药分子设计中的应用

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定量构效关系(QSAR)研究是农药分子设计中很重要的方法,本文详细介绍了2D-QSAR中的Hansch-Fujita方法及3D-QSAR中的比较分子场分析(CoMFA)方法和比较分子相似指数分析(CoMSIA)方法,并对Hansch-Fujita方法中使用的各种类型的参数进行了比较分析。并基于上述三种方法,开展了两方面的研究。 为了更全面地揭示2-芳基苯并二氢吡喃-4-酮类衍生物的抗菌活性与其结构之间的关系,在本课题组前期进行的Hanseh-Fujita QSAR分析的基础上,采用CoMFA、CoMSIA等3D-QSAR分析方法对其三维结构活性关系进行了探讨。与Hansch-Fujita QSAR分析的比较、组合加深了对该系列化合物的结构活性关系的理解,有助于构建配体与假想受体的连接模式。该连接模式无疑为进一步设计新型的抗菌试剂提供了很好的指导。 磺酰脲类除草剂的开发,一直是当前除草剂化学中一个重要的研究领域,一方面,科学家们基于磺酰脲类化合物的结构特征,提出了数种受体作用模型;另一方面,针对该类抑制剂的靶标(Acetohydroxyacid synthase [AHAS],EC2.2.1.6),构建了分子模型和对接模型。若能把抑制剂的构效关系与酶结合位点的性质联系起来研究,可能会得到更多有关除草剂抑制机理的信息。为此,鉴于Duggleby课题组最近报道的磺酰脲化合物和酵母AHAS复合物的晶体结构,本研究从氯嘧磺隆与AHAS酶催化亚基复合物晶体中提取氯嘧磺隆的构象为初始构象,构建了一系列磺酰脲类化合物。在DFT方法下,采用B3LYP函数对构建的结构进行了优化,并计算了基于静电势拟合的电荷。利用DFT方法计算的量子化学参数进行了Hansch-Fujita QSAR分析,同时采用CoMFA和CoMSIA等方法对磺酰脲类化合物的结构活性关系进行了探讨。得到的QSAR模型进一步验证了复合物中磺酰脲化合物与酶的连接模式,并为下一步的虚拟筛选提供了一个非常有用的工具。
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